Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUFIP1Q9UHK0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUFIP1Q9UHK0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUFIP1Q9UHK0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUFIP1Q9UHK0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms