Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFA13Q9P0J0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFA13Q9P0J0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFA13Q9P0J0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFA13Q9P0J0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFA13Q9P0J0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFA13Q9P0J0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFA13Q9P0J0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFA13Q9P0J0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFA13Q9P0J0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFA13Q9P0J0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFA13Q9P0J0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFA13Q9P0J0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFA13Q9P0J0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFA13Q9P0J0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDUFA13Q9P0J0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDUFA13Q9P0J0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFA13Q9P0J0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFA13Q9P0J0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFA13Q9P0J0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFA13Q9P0J0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFA13Q9P0J0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFA13Q9P0J0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFA13Q9P0J0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFA13Q9P0J0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFA13Q9P0J0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFA13Q9P0J0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFA13Q9P0J0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFA13Q9P0J0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDUFA13Q9P0J0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFA13Q9P0J0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms