Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SACSQ9NZJ4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SACSQ9NZJ4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SACSQ9NZJ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SACSQ9NZJ4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms