Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM160Q9NX00 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM160Q9NX00 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM160Q9NX00 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM160Q9NX00 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM160Q9NX00 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM160Q9NX00 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM160Q9NX00 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM160Q9NX00 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM160Q9NX00 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM160Q9NX00 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM160Q9NX00 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM160Q9NX00 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM160Q9NX00 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM160Q9NX00 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM160Q9NX00 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM160Q9NX00 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM160Q9NX00 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM160Q9NX00 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM160Q9NX00 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM160Q9NX00 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM160Q9NX00 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM160Q9NX00 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM160Q9NX00 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM160Q9NX00 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM160Q9NX00 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM160Q9NX00 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM160Q9NX00 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM160Q9NX00 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM160Q9NX00 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM160Q9NX00 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM160Q9NX00 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM160Q9NX00 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM160Q9NX00 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM160Q9NX00 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM160Q9NX00 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM160Q9NX00 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM160Q9NX00 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM160Q9NX00 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM160Q9NX00 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM160Q9NX00 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms