Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB16Q9NRJ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB16Q9NRJ7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB16Q9NRJ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB16Q9NRJ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB16Q9NRJ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB16Q9NRJ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB16Q9NRJ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB16Q9NRJ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB16Q9NRJ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB16Q9NRJ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB16Q9NRJ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB16Q9NRJ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB16Q9NRJ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB16Q9NRJ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB16Q9NRJ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB16Q9NRJ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB16Q9NRJ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB16Q9NRJ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB16Q9NRJ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB16Q9NRJ7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB16Q9NRJ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB16Q9NRJ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB16Q9NRJ7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB16Q9NRJ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB16Q9NRJ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB16Q9NRJ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB16Q9NRJ7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB16Q9NRJ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms