Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDLIM7Q9NR12 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDLIM7Q9NR12 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDLIM7Q9NR12 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDLIM7Q9NR12 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDLIM7Q9NR12 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDLIM7Q9NR12 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDLIM7Q9NR12 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDLIM7Q9NR12 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDLIM7Q9NR12 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDLIM7Q9NR12 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDLIM7Q9NR12 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDLIM7Q9NR12 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDLIM7Q9NR12 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDLIM7Q9NR12 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDLIM7Q9NR12 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDLIM7Q9NR12 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDLIM7Q9NR12 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDLIM7Q9NR12 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDLIM7Q9NR12 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDLIM7Q9NR12 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDLIM7Q9NR12 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDLIM7Q9NR12 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDLIM7Q9NR12 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDLIM7Q9NR12 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDLIM7Q9NR12 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDLIM7Q9NR12 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDLIM7Q9NR12 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDLIM7Q9NR12 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDLIM7Q9NR12 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDLIM7Q9NR12 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDLIM7Q9NR12 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDLIM7Q9NR12 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDLIM7Q9NR12 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDLIM7Q9NR12 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDLIM7Q9NR12 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDLIM7Q9NR12 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDLIM7Q9NR12 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDLIM7Q9NR12 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDLIM7Q9NR12 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDLIM7Q9NR12 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDLIM7Q9NR12 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDLIM7Q9NR12 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDLIM7Q9NR12 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDLIM7Q9NR12 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDLIM7Q9NR12 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PDLIM7Q9NR12 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDLIM7Q9NR12 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDLIM7Q9NR12 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PDLIM7Q9NR12 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDLIM7Q9NR12 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms