Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PLXNA4Q9HCM2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLXNA4Q9HCM2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLXNA4Q9HCM2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLXNA4Q9HCM2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLXNA4Q9HCM2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNA4Q9HCM2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNA4Q9HCM2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNA4Q9HCM2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNA4Q9HCM2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNA4Q9HCM2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNA4Q9HCM2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNA4Q9HCM2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNA4Q9HCM2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNA4Q9HCM2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNA4Q9HCM2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNA4Q9HCM2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNA4Q9HCM2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNA4Q9HCM2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNA4Q9HCM2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNA4Q9HCM2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNA4Q9HCM2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNA4Q9HCM2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLXNA4Q9HCM2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLXNA4Q9HCM2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNA4Q9HCM2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms