Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK4

ROBO2, Roundabout homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO2Q9HCK4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
ROBO2Q9HCK4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
ROBO2Q9HCK4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
ROBO2Q9HCK4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
ROBO2Q9HCK4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
ROBO2Q9HCK4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
ROBO2Q9HCK4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
ROBO2Q9HCK4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
ROBO2Q9HCK4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ROBO2Q9HCK4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ROBO2Q9HCK4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ROBO2Q9HCK4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ROBO2Q9HCK4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ROBO2Q9HCK4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ROBO2Q9HCK4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ROBO2Q9HCK4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ROBO2Q9HCK4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ROBO2Q9HCK4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ROBO2Q9HCK4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ROBO2Q9HCK4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
ROBO2Q9HCK4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ROBO2Q9HCK4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ROBO2Q9HCK4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ROBO2Q9HCK4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ROBO2Q9HCK4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ROBO2Q9HCK4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ROBO2Q9HCK4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ROBO2Q9HCK4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ROBO2Q9HCK4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ROBO2Q9HCK4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ROBO2Q9HCK4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ROBO2Q9HCK4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ROBO2Q9HCK4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ROBO2Q9HCK4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ROBO2Q9HCK4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ROBO2Q9HCK4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ROBO2Q9HCK4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ROBO2Q9HCK4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ROBO2Q9HCK4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ROBO2Q9HCK4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ROBO2Q9HCK4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ROBO2Q9HCK4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ROBO2Q9HCK4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ROBO2Q9HCK4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ROBO2Q9HCK4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ROBO2Q9HCK4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ROBO2Q9HCK4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ROBO2Q9HCK4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ROBO2Q9HCK4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ROBO2Q9HCK4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ROBO2Q9HCK4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ROBO2Q9HCK4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
ROBO2Q9HCK4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ROBO2Q9HCK4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ROBO2Q9HCK4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ROBO2Q9HCK4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ROBO2Q9HCK4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ROBO2Q9HCK4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ROBO2Q9HCK4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
ROBO2Q9HCK4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ROBO2Q9HCK4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
ROBO2Q9HCK4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ROBO2Q9HCK4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms