Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPTBN4Q9H254 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPTBN4Q9H254 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPTBN4Q9H254 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPTBN4Q9H254 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPTBN4Q9H254 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPTBN4Q9H254 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SPTBN4Q9H254 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPTBN4Q9H254 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPTBN4Q9H254 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPTBN4Q9H254 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SPTBN4Q9H254 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPTBN4Q9H254 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPTBN4Q9H254 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPTBN4Q9H254 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPTBN4Q9H254 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPTBN4Q9H254 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPTBN4Q9H254 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPTBN4Q9H254 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPTBN4Q9H254 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPTBN4Q9H254 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPTBN4Q9H254 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPTBN4Q9H254 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPTBN4Q9H254 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPTBN4Q9H254 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPTBN4Q9H254 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPTBN4Q9H254 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTBN4Q9H254 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTBN4Q9H254 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTBN4Q9H254 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPTBN4Q9H254 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPTBN4Q9H254 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTBN4Q9H254 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPTBN4Q9H254 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTBN4Q9H254 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTBN4Q9H254 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTBN4Q9H254 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTBN4Q9H254 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTBN4Q9H254 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTBN4Q9H254 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTBN4Q9H254 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTBN4Q9H254 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTBN4Q9H254 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTBN4Q9H254 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPTBN4Q9H254 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPTBN4Q9H254 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPTBN4Q9H254 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPTBN4Q9H254 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTBN4Q9H254 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTBN4Q9H254 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTBN4Q9H254 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTBN4Q9H254 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTBN4Q9H254 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTBN4Q9H254 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTBN4Q9H254 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTBN4Q9H254 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPTBN4Q9H254 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTBN4Q9H254 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTBN4Q9H254 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTBN4Q9H254 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTBN4Q9H254 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTBN4Q9H254 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTBN4Q9H254 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTBN4Q9H254 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTBN4Q9H254 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTBN4Q9H254 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTBN4Q9H254 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTBN4Q9H254 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTBN4Q9H254 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTBN4Q9H254 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTBN4Q9H254 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTBN4Q9H254 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTBN4Q9H254 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTBN4Q9H254 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTBN4Q9H254 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTBN4Q9H254 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms