Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms