Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCNX1Q96RV3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNX1Q96RV3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNX1Q96RV3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNX1Q96RV3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX1Q96RV3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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