Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATP2A3Q93084 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2A3Q93084 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2A3Q93084 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2A3Q93084 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2A3Q93084 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2A3Q93084 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2A3Q93084 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2A3Q93084 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2A3Q93084 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP2A3Q93084 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2A3Q93084 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2A3Q93084 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2A3Q93084 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2A3Q93084 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms