Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KLHDC9Q8NEP7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KLHDC9Q8NEP7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KLHDC9Q8NEP7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KLHDC9Q8NEP7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KLHDC9Q8NEP7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KLHDC9Q8NEP7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KLHDC9Q8NEP7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KLHDC9Q8NEP7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KLHDC9Q8NEP7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KLHDC9Q8NEP7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KLHDC9Q8NEP7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KLHDC9Q8NEP7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KLHDC9Q8NEP7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KLHDC9Q8NEP7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KLHDC9Q8NEP7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KLHDC9Q8NEP7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KLHDC9Q8NEP7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KLHDC9Q8NEP7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KLHDC9Q8NEP7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KLHDC9Q8NEP7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KLHDC9Q8NEP7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KLHDC9Q8NEP7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KLHDC9Q8NEP7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KLHDC9Q8NEP7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KLHDC9Q8NEP7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHDC9Q8NEP7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHDC9Q8NEP7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
KLHDC9Q8NEP7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KLHDC9Q8NEP7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHDC9Q8NEP7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHDC9Q8NEP7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHDC9Q8NEP7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHDC9Q8NEP7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHDC9Q8NEP7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLHDC9Q8NEP7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLHDC9Q8NEP7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLHDC9Q8NEP7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLHDC9Q8NEP7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLHDC9Q8NEP7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KLHDC9Q8NEP7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KLHDC9Q8NEP7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KLHDC9Q8NEP7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KLHDC9Q8NEP7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLHDC9Q8NEP7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLHDC9Q8NEP7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHDC9Q8NEP7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHDC9Q8NEP7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHDC9Q8NEP7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLHDC9Q8NEP7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLHDC9Q8NEP7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KLHDC9Q8NEP7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KLHDC9Q8NEP7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KLHDC9Q8NEP7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
KLHDC9Q8NEP7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KLHDC9Q8NEP7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KLHDC9Q8NEP7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLHDC9Q8NEP7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLHDC9Q8NEP7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms