Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CARMIL3Q8ND23 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CARMIL3Q8ND23 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL3Q8ND23 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL3Q8ND23 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL3Q8ND23 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL3Q8ND23 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL3Q8ND23 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL3Q8ND23 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL3Q8ND23 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL3Q8ND23 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL3Q8ND23 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL3Q8ND23 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL3Q8ND23 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL3Q8ND23 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL3Q8ND23 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL3Q8ND23 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL3Q8ND23 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL3Q8ND23 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL3Q8ND23 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL3Q8ND23 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL3Q8ND23 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL3Q8ND23 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL3Q8ND23 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL3Q8ND23 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL3Q8ND23 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL3Q8ND23 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL3Q8ND23 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL3Q8ND23 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL3Q8ND23 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL3Q8ND23 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL3Q8ND23 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL3Q8ND23 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL3Q8ND23 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL3Q8ND23 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL3Q8ND23 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL3Q8ND23 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CARMIL3Q8ND23 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL3Q8ND23 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL3Q8ND23 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL3Q8ND23 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL3Q8ND23 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CARMIL3Q8ND23 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL3Q8ND23 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL3Q8ND23 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL3Q8ND23 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CARMIL3Q8ND23 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL3Q8ND23 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL3Q8ND23 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CARMIL3Q8ND23 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL3Q8ND23 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL3Q8ND23 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL3Q8ND23 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CARMIL3Q8ND23 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL3Q8ND23 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CARMIL3Q8ND23 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL3Q8ND23 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL3Q8ND23 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL3Q8ND23 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CARMIL3Q8ND23 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CARMIL3Q8ND23 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms