Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHST4Q8NCG5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST4Q8NCG5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST4Q8NCG5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST4Q8NCG5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHST4Q8NCG5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHST4Q8NCG5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CHST4Q8NCG5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST4Q8NCG5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST4Q8NCG5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST4Q8NCG5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST4Q8NCG5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST4Q8NCG5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms