Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX8Q7RTT4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX8Q7RTT4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSX8Q7RTT4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms