Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX9Q7RTT3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX9Q7RTT3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX9Q7RTT3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX9Q7RTT3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSX9Q7RTT3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX9Q7RTT3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSX9Q7RTT3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX9Q7RTT3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms