Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MICAL3Q7RTP6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MICAL3Q7RTP6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MICAL3Q7RTP6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MICAL3Q7RTP6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MICAL3Q7RTP6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MICAL3Q7RTP6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MICAL3Q7RTP6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MICAL3Q7RTP6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MICAL3Q7RTP6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MICAL3Q7RTP6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MICAL3Q7RTP6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MICAL3Q7RTP6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MICAL3Q7RTP6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MICAL3Q7RTP6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MICAL3Q7RTP6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MICAL3Q7RTP6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MICAL3Q7RTP6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MICAL3Q7RTP6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MICAL3Q7RTP6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MICAL3Q7RTP6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MICAL3Q7RTP6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MICAL3Q7RTP6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MICAL3Q7RTP6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MICAL3Q7RTP6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MICAL3Q7RTP6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MICAL3Q7RTP6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MICAL3Q7RTP6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms