Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00173Q6ZV60 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00173Q6ZV60 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00173Q6ZV60 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00173Q6ZV60 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms