Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT03

NUTM2D, NUT family member 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUTM2DQ5VT03 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NUTM2DQ5VT03 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
NUTM2DQ5VT03 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
NUTM2DQ5VT03 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NUTM2DQ5VT03 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NUTM2DQ5VT03 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NUTM2DQ5VT03 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
NUTM2DQ5VT03 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
NUTM2DQ5VT03 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
NUTM2DQ5VT03 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NUTM2DQ5VT03 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NUTM2DQ5VT03 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NUTM2DQ5VT03 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NUTM2DQ5VT03 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NUTM2DQ5VT03 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NUTM2DQ5VT03 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NUTM2DQ5VT03 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NUTM2DQ5VT03 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NUTM2DQ5VT03 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
NUTM2DQ5VT03 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
NUTM2DQ5VT03 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
NUTM2DQ5VT03 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
NUTM2DQ5VT03 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
NUTM2DQ5VT03 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NUTM2DQ5VT03 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NUTM2DQ5VT03 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NUTM2DQ5VT03 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NUTM2DQ5VT03 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
NUTM2DQ5VT03 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NUTM2DQ5VT03 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NUTM2DQ5VT03 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NUTM2DQ5VT03 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NUTM2DQ5VT03 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NUTM2DQ5VT03 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NUTM2DQ5VT03 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NUTM2DQ5VT03 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NUTM2DQ5VT03 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NUTM2DQ5VT03 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NUTM2DQ5VT03 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NUTM2DQ5VT03 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NUTM2DQ5VT03 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NUTM2DQ5VT03 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NUTM2DQ5VT03 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NUTM2DQ5VT03 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NUTM2DQ5VT03 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NUTM2DQ5VT03 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NUTM2DQ5VT03 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NUTM2DQ5VT03 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NUTM2DQ5VT03 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
NUTM2DQ5VT03 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NUTM2DQ5VT03 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NUTM2DQ5VT03 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms