Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NHLRC3Q5JS37 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NHLRC3Q5JS37 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLRC3Q5JS37 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLRC3Q5JS37 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms