Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC1Q15751 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC1Q15751 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC1Q15751 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC1Q15751 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERC1Q15751 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC1Q15751 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC1Q15751 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC1Q15751 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC1Q15751 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC1Q15751 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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