Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RYR3Q15413 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RYR3Q15413 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RYR3Q15413 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RYR3Q15413 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RYR3Q15413 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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