Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELOBQ15370 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELOBQ15370 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELOBQ15370 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELOBQ15370 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELOBQ15370 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELOBQ15370 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELOBQ15370 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELOBQ15370 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELOBQ15370 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELOBQ15370 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELOBQ15370 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELOBQ15370 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELOBQ15370 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELOBQ15370 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELOBQ15370 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELOBQ15370 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELOBQ15370 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELOBQ15370 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELOBQ15370 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELOBQ15370 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELOBQ15370 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELOBQ15370 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELOBQ15370 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELOBQ15370 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELOBQ15370 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOBQ15370 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELOBQ15370 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELOBQ15370 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms