Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
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SNX17Q15036 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
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SNX17Q15036 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNX17Q15036 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNX17Q15036 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
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SNX17Q15036 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
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SNX17Q15036 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNX17Q15036 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNX17Q15036 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
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