Protein–RNA interactions for Protein: Q14CW9

ATXN7L3, Ataxin-7-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3Q14CW9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3Q14CW9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATXN7L3Q14CW9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7L3Q14CW9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7L3Q14CW9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms