Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCINQ13939 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCINQ13939 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCINQ13939 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCINQ13939 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCINQ13939 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCINQ13939 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCINQ13939 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCINQ13939 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCINQ13939 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCINQ13939 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCINQ13939 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCINQ13939 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCINQ13939 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCINQ13939 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCINQ13939 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCINQ13939 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCINQ13939 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCINQ13939 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCINQ13939 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCINQ13939 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCINQ13939 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCINQ13939 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCINQ13939 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCINQ13939 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CCINQ13939 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCINQ13939 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCINQ13939 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCINQ13939 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCINQ13939 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCINQ13939 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCINQ13939 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCINQ13939 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCINQ13939 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCINQ13939 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCINQ13939 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCINQ13939 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCINQ13939 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCINQ13939 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCINQ13939 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCINQ13939 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCINQ13939 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCINQ13939 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCINQ13939 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCINQ13939 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCINQ13939 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCINQ13939 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCINQ13939 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCINQ13939 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCINQ13939 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCINQ13939 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCINQ13939 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCINQ13939 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCINQ13939 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCINQ13939 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCINQ13939 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCINQ13939 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCINQ13939 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCINQ13939 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCINQ13939 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCINQ13939 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCINQ13939 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCINQ13939 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCINQ13939 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCINQ13939 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCINQ13939 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCINQ13939 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCINQ13939 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCINQ13939 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCINQ13939 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCINQ13939 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCINQ13939 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCINQ13939 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCINQ13939 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCINQ13939 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCINQ13939 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCINQ13939 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCINQ13939 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCINQ13939 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCINQ13939 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCINQ13939 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCINQ13939 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCINQ13939 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCINQ13939 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCINQ13939 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCINQ13939 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCINQ13939 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCINQ13939 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCINQ13939 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCINQ13939 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCINQ13939 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCINQ13939 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCINQ13939 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCINQ13939 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCINQ13939 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCINQ13939 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCINQ13939 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCINQ13939 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCINQ13939 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCINQ13939 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
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