Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1DQ13901 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1DQ13901 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1DQ13901 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1DQ13901 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1DQ13901 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1DQ13901 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1DQ13901 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1DQ13901 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1DQ13901 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1DQ13901 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1DQ13901 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1DQ13901 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1DQ13901 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1DQ13901 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1DQ13901 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1DQ13901 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1DQ13901 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C1DQ13901 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C1DQ13901 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1DQ13901 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1DQ13901 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1DQ13901 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1DQ13901 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1DQ13901 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1DQ13901 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1DQ13901 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1DQ13901 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1DQ13901 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1DQ13901 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1DQ13901 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1DQ13901 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1DQ13901 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1DQ13901 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1DQ13901 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1DQ13901 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1DQ13901 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1DQ13901 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1DQ13901 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C1DQ13901 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1DQ13901 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1DQ13901 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1DQ13901 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1DQ13901 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1DQ13901 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1DQ13901 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1DQ13901 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1DQ13901 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1DQ13901 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1DQ13901 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1DQ13901 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1DQ13901 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1DQ13901 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1DQ13901 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1DQ13901 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1DQ13901 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1DQ13901 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1DQ13901 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1DQ13901 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1DQ13901 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1DQ13901 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1DQ13901 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1DQ13901 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1DQ13901 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C1DQ13901 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1DQ13901 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1DQ13901 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1DQ13901 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1DQ13901 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1DQ13901 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1DQ13901 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1DQ13901 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1DQ13901 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1DQ13901 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1DQ13901 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1DQ13901 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1DQ13901 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1DQ13901 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1DQ13901 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1DQ13901 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1DQ13901 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1DQ13901 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1DQ13901 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1DQ13901 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1DQ13901 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
C1DQ13901 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1DQ13901 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1DQ13901 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1DQ13901 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1DQ13901 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C1DQ13901 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1DQ13901 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1DQ13901 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1DQ13901 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1DQ13901 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1DQ13901 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1DQ13901 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1DQ13901 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1DQ13901 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1DQ13901 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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