Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
TNFAIP1Q13829 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNFAIP1Q13829 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNFAIP1Q13829 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNFAIP1Q13829 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNFAIP1Q13829 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNFAIP1Q13829 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNFAIP1Q13829 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNFAIP1Q13829 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNFAIP1Q13829 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TNFAIP1Q13829 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNFAIP1Q13829 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TNFAIP1Q13829 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNFAIP1Q13829 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNFAIP1Q13829 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNFAIP1Q13829 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TNFAIP1Q13829 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TNFAIP1Q13829 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TNFAIP1Q13829 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TNFAIP1Q13829 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNFAIP1Q13829 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNFAIP1Q13829 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
TNFAIP1Q13829 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TNFAIP1Q13829 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNFAIP1Q13829 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TNFAIP1Q13829 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TNFAIP1Q13829 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TNFAIP1Q13829 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TNFAIP1Q13829 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TNFAIP1Q13829 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TNFAIP1Q13829 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
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TNFAIP1Q13829 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
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TNFAIP1Q13829 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TNFAIP1Q13829 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TNFAIP1Q13829 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TNFAIP1Q13829 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TNFAIP1Q13829 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TNFAIP1Q13829 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TNFAIP1Q13829 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNFAIP1Q13829 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNFAIP1Q13829 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNFAIP1Q13829 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TNFAIP1Q13829 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TNFAIP1Q13829 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNFAIP1Q13829 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNFAIP1Q13829 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TNFAIP1Q13829 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNFAIP1Q13829 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNFAIP1Q13829 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
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