Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PKD2Q13563 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PKD2Q13563 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PKD2Q13563 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PKD2Q13563 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PKD2Q13563 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PKD2Q13563 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
PKD2Q13563 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PKD2Q13563 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PKD2Q13563 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PKD2Q13563 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PKD2Q13563 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PKD2Q13563 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PKD2Q13563 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PKD2Q13563 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
PKD2Q13563 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
PKD2Q13563 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
PKD2Q13563 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
PKD2Q13563 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PKD2Q13563 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PKD2Q13563 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PKD2Q13563 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PKD2Q13563 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
PKD2Q13563 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
PKD2Q13563 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PKD2Q13563 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PKD2Q13563 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PKD2Q13563 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PKD2Q13563 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PKD2Q13563 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
PKD2Q13563 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PKD2Q13563 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PKD2Q13563 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PKD2Q13563 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PKD2Q13563 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PKD2Q13563 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PKD2Q13563 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PKD2Q13563 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PKD2Q13563 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PKD2Q13563 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PKD2Q13563 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PKD2Q13563 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PKD2Q13563 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PKD2Q13563 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PKD2Q13563 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PKD2Q13563 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PKD2Q13563 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PKD2Q13563 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PKD2Q13563 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PKD2Q13563 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PKD2Q13563 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PKD2Q13563 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PKD2Q13563 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PKD2Q13563 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PKD2Q13563 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PKD2Q13563 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
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