Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 THP3YPR045C 1413 nt11.28□□□□□ -0.6
SLM3Q12093 ADH3YMR083W 1128 nt11.28□□□□□ -0.6
SLM3Q12093 SPP2YOR148C 558 nt11.27□□□□□ -0.61
SLM3Q12093 BIO5YNR056C 1686 nt11.27□□□□□ -0.61
SLM3Q12093 PHB2YGR231C 933 nt11.26□□□□□ -0.61
SLM3Q12093 SER2YGR208W 930 nt11.24□□□□□ -0.61
SLM3Q12093 MOB1YIL106W 945 nt11.24□□□□□ -0.61
SLM3Q12093 RRT8YOL048C 1029 nt11.24□□□□□ -0.61
SLM3Q12093 RCR1YBR005W 642 nt11.24□□□□□ -0.61
SLM3Q12093 YJL067WYJL067W 351 nt11.23□□□□□ -0.61
SLM3Q12093 TVP23YDR084C 600 nt11.22□□□□□ -0.61
SLM3Q12093 YOR343CYOR343C 327 nt11.22□□□□□ -0.61
SLM3Q12093 ERG13YML126C 1476 nt11.21□□□□□ -0.61
SLM3Q12093 PAU21YOR394W 495 nt11.2□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 PAU22YPL282C 495 nt11.2□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 ASP3-1YLR155C 1089 nt11.19□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 ASP3-2YLR157C 1089 nt11.19□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 ASP3-3YLR158C 1089 nt11.19□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 ASP3-4YLR160C 1089 nt11.19□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 CWC15YDR163W 528 nt11.17□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 CYC3YAL039C 810 nt11.17□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 ENO2YHR174W 1314 nt11.16□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 RPL12BYDR418W 498 nt11.16□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 TPC1YGR096W 945 nt11.16□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 BET2YPR176C 978 nt11.16□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 TGA1tA(UGC)A 73 nt11.15□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt11.15□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt11.15□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt11.15□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt11.15□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt11.15□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 OPI3YJR073C 621 nt11.15□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 FSH2YMR222C 672 nt11.15□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 HTS1YPR033C 1641 nt11.15□□□□□ -0.62
SLM3Q12093 PCP1YGR101W 1041 nt11.14□□□□□ -0.63
SLM3Q12093 FCY1YPR062W 477 nt11.13□□□□□ -0.63
SLM3Q12093 ACH1YBL015W 1581 nt11.12□□□□□ -0.63
SLM3Q12093 GRH1YDR517W 1119 nt11.11□□□□□ -0.63
SLM3Q12093 YKR012CYKR012C 378 nt11.11□□□□□ -0.63
SLM3Q12093 HRA1HRA1 564 nt11.1□□□□□ -0.63
SLM3Q12093 VPS62YGR141W 1404 nt11.08□□□□□ -0.64
SLM3Q12093 AMF1YOR378W 1548 nt11.07□□□□□ -0.64
SLM3Q12093 DIG1YPL049C 1359 nt11.06□□□□□ -0.64
SLM3Q12093 YGR210CYGR210C 1236 nt11.06□□□□□ -0.64
SLM3Q12093 YOR268CYOR268C 399 nt11.06□□□□□ -0.64
SLM3Q12093 ERO1YML130C 1692 nt11.01□□□□□ -0.65
SLM3Q12093 YLR280CYLR280C 351 nt11.01□□□□□ -0.65
SLM3Q12093 SAC7YDR389W 1965 nt11□□□□□ -0.65
SLM3Q12093 LEU2YCL018W 1095 nt11□□□□□ -0.65
SLM3Q12093 SDS24YBR214W 1584 nt10.99□□□□□ -0.65
SLM3Q12093 AIM1YAL046C 357 nt10.99□□□□□ -0.65
SLM3Q12093 SRP102YKL154W 735 nt10.99□□□□□ -0.65
SLM3Q12093 EMC3YKL207W 762 nt10.99□□□□□ -0.65
SLM3Q12093 ENO1YGR254W 1314 nt10.98□□□□□ -0.65
SLM3Q12093 MFG1YDL233W 1377 nt10.98□□□□□ -0.65
SLM3Q12093 NAM8YHR086W 1572 nt10.98□□□□□ -0.65
SLM3Q12093 LSB6YJL100W 1824 nt10.98□□□□□ -0.65
SLM3Q12093 YDL086WYDL086W 822 nt10.97□□□□□ -0.65
SLM3Q12093 KAE1YKR038C 1161 nt10.95□□□□□ -0.66
SLM3Q12093 YJL160CYJL160C 864 nt10.92□□□□□ -0.66
SLM3Q12093 YNR064CYNR064C 873 nt10.92□□□□□ -0.66
SLM3Q12093 VBA3YCL069W 1377 nt10.91□□□□□ -0.66
SLM3Q12093 YPL108WYPL108W 507 nt10.91□□□□□ -0.66
SLM3Q12093 YMR210WYMR210W 1350 nt10.9□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 ALG12YNR030W 1656 nt10.89□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 MRP1YDR347W 966 nt10.88□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 HOG1YLR113W 1308 nt10.87□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 PBP1YGR178C 2169 nt10.87□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 ELO1YJL196C 933 nt10.86□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 YMR206WYMR206W 942 nt10.85□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 EDC2YER035W 438 nt10.84□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt10.84□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt10.84□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt10.84□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 SUP51tL(UAA)J 84 nt10.84□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt10.84□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt10.84□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt10.84□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 ENT4YLL038C 744 nt10.84□□□□□ -0.67
SLM3Q12093 TOS1YBR162C 1368 nt10.83□□□□□ -0.68
SLM3Q12093 REX2YLR059C 810 nt10.83□□□□□ -0.68
SLM3Q12093 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.82□□□□□ -0.68
SLM3Q12093 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.82□□□□□ -0.68
SLM3Q12093 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.81□□□□□ -0.68
SLM3Q12093 SWT21YNL187W 1074 nt10.81□□□□□ -0.68
SLM3Q12093 RIM2YBR192W 1134 nt10.81□□□□□ -0.68
SLM3Q12093 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.8□□□□□ -0.68
SLM3Q12093 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.8□□□□□ -0.68
SLM3Q12093 SFL1YOR140W 2301 nt10.79□□□□□ -0.68
SLM3Q12093 YLR046CYLR046C 813 nt10.79□□□□□ -0.68
SLM3Q12093 KEL3YPL263C 1956 nt10.79□□□□□ -0.68
SLM3Q12093 YKL053WYKL053W 375 nt10.77□□□□□ -0.69
SLM3Q12093 LSP1YPL004C 1026 nt10.77□□□□□ -0.69
SLM3Q12093 GDH1YOR375C 1365 nt10.77□□□□□ -0.69
SLM3Q12093 MET1YKR069W 1782 nt10.76□□□□□ -0.69
SLM3Q12093 PET18YCR020C 648 nt10.76□□□□□ -0.69
SLM3Q12093 CYT2YKL087C 675 nt10.76□□□□□ -0.69
SLM3Q12093 CCT2YIL142W 1584 nt10.74□□□□□ -0.69
SLM3Q12093 SRP54YPR088C 1626 nt10.74□□□□□ -0.69
SLM3Q12093 UTR5YEL035C 501 nt10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.7 ms