Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 DDI1YER143W 1287 nt10.77□□□□□ -0.69
CTI6Q08923 FLX1YIL134W 936 nt10.75□□□□□ -0.69
CTI6Q08923 PET8YNL003C 855 nt10.75□□□□□ -0.69
CTI6Q08923 YOR343CYOR343C 327 nt10.75□□□□□ -0.69
CTI6Q08923 YMR007WYMR007W 381 nt10.73□□□□□ -0.69
CTI6Q08923 PAU21YOR394W 495 nt10.73□□□□□ -0.69
CTI6Q08923 PAU22YPL282C 495 nt10.73□□□□□ -0.69
CTI6Q08923 SPT20YOL148C 1815 nt10.72□□□□□ -0.69
CTI6Q08923 RPL12BYDR418W 498 nt10.71□□□□□ -0.69
CTI6Q08923 THP3YPR045C 1413 nt10.71□□□□□ -0.69
CTI6Q08923 HEM13YDR044W 987 nt10.7□□□□□ -0.7
CTI6Q08923 YJL067WYJL067W 351 nt10.69□□□□□ -0.7
CTI6Q08923 OSH7YHR001W 1314 nt10.68□□□□□ -0.7
CTI6Q08923 SOL2YCR073W-A 948 nt10.68□□□□□ -0.7
CTI6Q08923 PHB2YGR231C 933 nt10.68□□□□□ -0.7
CTI6Q08923 YPS3YLR121C 1527 nt10.68□□□□□ -0.7
CTI6Q08923 LSM5YER146W 282 nt10.67□□□□□ -0.7
CTI6Q08923 RRT8YOL048C 1029 nt10.67□□□□□ -0.7
CTI6Q08923 YDR455CYDR455C 309 nt10.66□□□□□ -0.7
CTI6Q08923 SER2YGR208W 930 nt10.66□□□□□ -0.7
CTI6Q08923 FMS1YMR020W 1527 nt10.65□□□□□ -0.7
CTI6Q08923 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt10.65□□□□□ -0.7
CTI6Q08923 RSC8YFR037C 1674 nt10.65□□□□□ -0.7
CTI6Q08923 TAT2YOL020W 1779 nt10.65□□□□□ -0.71
CTI6Q08923 ZRT3YKL175W 1512 nt10.64□□□□□ -0.71
CTI6Q08923 INA1YLR413W 2028 nt10.64□□□□□ -0.71
CTI6Q08923 RCR1YBR005W 642 nt10.64□□□□□ -0.71
CTI6Q08923 TVP23YDR084C 600 nt10.63□□□□□ -0.71
CTI6Q08923 ADH3YMR083W 1128 nt10.63□□□□□ -0.71
CTI6Q08923 YOR268CYOR268C 399 nt10.62□□□□□ -0.71
CTI6Q08923 ABZ2YMR289W 1125 nt10.61□□□□□ -0.71
CTI6Q08923 FSH2YMR222C 672 nt10.6□□□□□ -0.71
CTI6Q08923 HRA1HRA1 564 nt10.59□□□□□ -0.71
CTI6Q08923 MFG1YDL233W 1377 nt10.57□□□□□ -0.72
CTI6Q08923 SPE2YOL052C 1191 nt10.57□□□□□ -0.72
CTI6Q08923 HTS1YPR033C 1641 nt10.56□□□□□ -0.72
CTI6Q08923 CYC3YAL039C 810 nt10.56□□□□□ -0.72
CTI6Q08923 HOL1YNR055C 1761 nt10.56□□□□□ -0.72
CTI6Q08923 ADE8YDR408C 645 nt10.55□□□□□ -0.72
CTI6Q08923 ACH1YBL015W 1581 nt10.53□□□□□ -0.72
CTI6Q08923 GRH1YDR517W 1119 nt10.53□□□□□ -0.72
CTI6Q08923 MUP1YGR055W 1725 nt10.53□□□□□ -0.72
CTI6Q08923 MOB1YIL106W 945 nt10.52□□□□□ -0.73
CTI6Q08923 OPI3YJR073C 621 nt10.52□□□□□ -0.73
CTI6Q08923 YOR325WYOR325W 474 nt10.52□□□□□ -0.73
CTI6Q08923 BET2YPR176C 978 nt10.52□□□□□ -0.73
CTI6Q08923 ERG13YML126C 1476 nt10.52□□□□□ -0.73
CTI6Q08923 SPP2YOR148C 558 nt10.51□□□□□ -0.73
CTI6Q08923 PCP1YGR101W 1041 nt10.5□□□□□ -0.73
CTI6Q08923 EDC2YER035W 438 nt10.47□□□□□ -0.73
CTI6Q08923 YGR210CYGR210C 1236 nt10.47□□□□□ -0.73
CTI6Q08923 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.47□□□□□ -0.73
CTI6Q08923 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.47□□□□□ -0.73
CTI6Q08923 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.47□□□□□ -0.73
CTI6Q08923 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.47□□□□□ -0.73
CTI6Q08923 DIG1YPL049C 1359 nt10.44□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 TGA1tA(UGC)A 73 nt10.44□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt10.44□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt10.44□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt10.44□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt10.44□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 TPC1YGR096W 945 nt10.44□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 SRP102YKL154W 735 nt10.43□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 TOS1YBR162C 1368 nt10.42□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 ILV3YJR016C 1758 nt10.42□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 EMC3YKL207W 762 nt10.41□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 YMR206WYMR206W 942 nt10.41□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 SAC7YDR389W 1965 nt10.41□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 AMF1YOR378W 1548 nt10.4□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 MRP1YDR347W 966 nt10.4□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 YKR012CYKR012C 378 nt10.4□□□□□ -0.74
CTI6Q08923 SDS24YBR214W 1584 nt10.39□□□□□ -0.75
CTI6Q08923 ERO1YML130C 1692 nt10.39□□□□□ -0.75
CTI6Q08923 YJL160CYJL160C 864 nt10.39□□□□□ -0.75
CTI6Q08923 HOG1YLR113W 1308 nt10.38□□□□□ -0.75
CTI6Q08923 RIM8YGL045W 1629 nt10.38□□□□□ -0.75
CTI6Q08923 ENO2YHR174W 1314 nt10.37□□□□□ -0.75
CTI6Q08923 LSB6YJL100W 1824 nt10.37□□□□□ -0.75
CTI6Q08923 FCY1YPR062W 477 nt10.36□□□□□ -0.75
CTI6Q08923 YGL114WYGL114W 2178 nt10.36□□□□□ -0.75
CTI6Q08923 CWC15YDR163W 528 nt10.35□□□□□ -0.75
CTI6Q08923 YLR280CYLR280C 351 nt10.35□□□□□ -0.75
CTI6Q08923 YPL108WYPL108W 507 nt10.35□□□□□ -0.75
CTI6Q08923 LEU2YCL018W 1095 nt10.35□□□□□ -0.75
CTI6Q08923 HEL2YDR266C 1920 nt10.35□□□□□ -0.75
CTI6Q08923 VBA3YCL069W 1377 nt10.34□□□□□ -0.75
CTI6Q08923 VPS62YGR141W 1404 nt10.33□□□□□ -0.76
CTI6Q08923 ENO1YGR254W 1314 nt10.33□□□□□ -0.76
CTI6Q08923 ZAP1YJL056C 2643 nt10.31□□□□□ -0.76
CTI6Q08923 YMR210WYMR210W 1350 nt10.31□□□□□ -0.76
CTI6Q08923 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.31□□□□□ -0.76
CTI6Q08923 NAM8YHR086W 1572 nt10.31□□□□□ -0.76
CTI6Q08923 ARO8YGL202W 1503 nt10.3□□□□□ -0.76
CTI6Q08923 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt10.29□□□□□ -0.76
CTI6Q08923 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt10.29□□□□□ -0.76
CTI6Q08923 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt10.29□□□□□ -0.76
CTI6Q08923 SUP51tL(UAA)J 84 nt10.29□□□□□ -0.76
CTI6Q08923 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt10.29□□□□□ -0.76
CTI6Q08923 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt10.29□□□□□ -0.76
CTI6Q08923 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.8 ms