Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 LYS20YDL182W 1287 nt9.11□□□□□ -0.95
SGO1Q08490 YOR325WYOR325W 474 nt9.09□□□□□ -0.95
SGO1Q08490 ILV3YJR016C 1758 nt9.09□□□□□ -0.95
SGO1Q08490 EAF3YPR023C 1206 nt9.08□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 MET8YBR213W 825 nt9.08□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 UFO1YML088W 2007 nt9.08□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 SEC61YLR378C 1443 nt9.07□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 RPL12BYDR418W 498 nt9.07□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 NAS2YIL007C 663 nt9.07□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 RAS2YNL098C 969 nt9.07□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 YOR343CYOR343C 327 nt9.07□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 UGP1YKL035W 1500 nt9.06□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 FUB1YCR076C 753 nt9.06□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 OXA1YER154W 1209 nt9.05□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 PAU21YOR394W 495 nt9.05□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 PAU22YPL282C 495 nt9.05□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 YHL008CYHL008C 1884 nt9.04□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 HIS2YFR025C 1008 nt9.04□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 YMR007WYMR007W 381 nt9.04□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 TMA23YMR269W 636 nt9.04□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 SAM2YDR502C 1155 nt9.03□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 YER188WYER188W 720 nt9.03□□□□□ -0.96
SGO1Q08490 COQ8YGL119W 1506 nt9.02□□□□□ -0.97
SGO1Q08490 FLX1YIL134W 936 nt9.02□□□□□ -0.97
SGO1Q08490 SHY1YGR112W 1170 nt9.01□□□□□ -0.97
SGO1Q08490 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt9.01□□□□□ -0.97
SGO1Q08490 FRE6YLL051C 2139 nt9.01□□□□□ -0.97
SGO1Q08490 SPS100YHR139C 981 nt9□□□□□ -0.97
SGO1Q08490 DDI1YER143W 1287 nt8.99□□□□□ -0.97
SGO1Q08490 YOR268CYOR268C 399 nt8.99□□□□□ -0.97
SGO1Q08490 URA8YJR103W 1737 nt8.99□□□□□ -0.97
SGO1Q08490 PSD1YNL169C 1503 nt8.99□□□□□ -0.97
SGO1Q08490 RCR1YBR005W 642 nt8.98□□□□□ -0.97
SGO1Q08490 OYE3YPL171C 1203 nt8.98□□□□□ -0.97
SGO1Q08490 MFG1YDL233W 1377 nt8.98□□□□□ -0.97
SGO1Q08490 IMO32YGR031W 1029 nt8.97□□□□□ -0.97
SGO1Q08490 ESBP6YNL125C 2022 nt8.96□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 ARO8YGL202W 1503 nt8.95□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.95□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.95□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 ILV2YMR108W 2064 nt8.95□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 SER2YGR208W 930 nt8.94□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 URA6YKL024C 615 nt8.94□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 THP3YPR045C 1413 nt8.94□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 HRA1HRA1 564 nt8.93□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 PHB2YGR231C 933 nt8.92□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 DLD2YDL178W 1593 nt8.91□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 LSM5YER146W 282 nt8.91□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 ADH3YMR083W 1128 nt8.91□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 SGA1YIL099W 1650 nt8.91□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 FLR1YBR008C 1647 nt8.91□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 KES1YPL145C 1305 nt8.9□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 GRH1YDR517W 1119 nt8.9□□□□□ -0.98
SGO1Q08490 TOS1YBR162C 1368 nt8.89□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 RSC8YFR037C 1674 nt8.89□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 PET8YNL003C 855 nt8.89□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 OPI10YOL032W 741 nt8.89□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 SPE2YOL052C 1191 nt8.89□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 OSH7YHR001W 1314 nt8.88□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 PCP1YGR101W 1041 nt8.88□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 BET2YPR176C 978 nt8.88□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 HTS1YPR033C 1641 nt8.87□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 ABZ2YMR289W 1125 nt8.87□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 CYT1YOR065W 930 nt8.87□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 HOG1YLR113W 1308 nt8.86□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 SOL2YCR073W-A 948 nt8.86□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 DMA2YNL116W 1569 nt8.86□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 CYC3YAL039C 810 nt8.85□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 CCT2YIL142W 1584 nt8.85□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 ZAP1YJL056C 2643 nt8.84□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 MOB1YIL106W 945 nt8.84□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 GAL2YLR081W 1725 nt8.84□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 FSH2YMR222C 672 nt8.84□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 DTR1YBR180W 1719 nt8.84□□□□□ -0.99
SGO1Q08490 HXK1YFR053C 1458 nt8.83□□□□□ -1
SGO1Q08490 EDC2YER035W 438 nt8.83□□□□□ -1
SGO1Q08490 YMR206WYMR206W 942 nt8.83□□□□□ -1
SGO1Q08490 ALD5YER073W 1563 nt8.82□□□□□ -1
SGO1Q08490 YPS3YLR121C 1527 nt8.82□□□□□ -1
SGO1Q08490 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.82□□□□□ -1
SGO1Q08490 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.82□□□□□ -1
SGO1Q08490 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.82□□□□□ -1
SGO1Q08490 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.82□□□□□ -1
SGO1Q08490 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.82□□□□□ -1
SGO1Q08490 GTB1YDR221W 2109 nt8.82□□□□□ -1
SGO1Q08490 ADE8YDR408C 645 nt8.82□□□□□ -1
SGO1Q08490 YDR455CYDR455C 309 nt8.82□□□□□ -1
SGO1Q08490 YJR154WYJR154W 1041 nt8.82□□□□□ -1
SGO1Q08490 RRT8YOL048C 1029 nt8.82□□□□□ -1
SGO1Q08490 LSB6YJL100W 1824 nt8.82□□□□□ -1
SGO1Q08490 HEM13YDR044W 987 nt8.81□□□□□ -1
SGO1Q08490 Q0010Q0010 387 nt8.81□□□□□ -1
SGO1Q08490 TVP23YDR084C 600 nt8.8□□□□□ -1
SGO1Q08490 TAT2YOL020W 1779 nt8.79□□□□□ -1
SGO1Q08490 FMS1YMR020W 1527 nt8.79□□□□□ -1
SGO1Q08490 YHR218WYHR218W 1812 nt8.77□□□□□ -1
SGO1Q08490 CWC15YDR163W 528 nt8.77□□□□□ -1.01
SGO1Q08490 CSM2YIL132C 642 nt8.77□□□□□ -1.01
SGO1Q08490 FCY1YPR062W 477 nt8.77□□□□□ -1.01
SGO1Q08490 YGR210CYGR210C 1236 nt8.76□□□□□ -1.01
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