Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 LSM5YER146W 282 nt7.44□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 YPI1YFR003C 468 nt7.44□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 EAF3YPR023C 1206 nt7.44□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 TAT2YOL020W 1779 nt7.43□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 YJL055WYJL055W 738 nt7.43□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 HXT12YIL170W 1374 nt7.43□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 SAM3YPL274W 1764 nt7.42□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 RBG2YGR173W 1107 nt7.42□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 ZAP1YJL056C 2643 nt7.42□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 TPS1YBR126C 1488 nt7.42□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 MRS6YOR370C 1812 nt7.41□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 DMA2YNL116W 1569 nt7.4□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 THI6YPL214C 1623 nt7.4□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 DUR3YHL016C 2208 nt7.4□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 LPD1YFL018C 1500 nt7.39□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 ODC1YPL134C 933 nt7.39□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 DLD3YEL071W 1491 nt7.38□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 MCM5YLR274W 2328 nt7.38□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 YHR219WYHR219W 1875 nt7.37□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 RPD3YNL330C 1302 nt7.37□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 MEX67YPL169C 1800 nt7.37□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 TIM44YIL022W 1296 nt7.37□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 RIB2YOL066C 1776 nt7.37□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 YDR455CYDR455C 309 nt7.36□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 DDI1YER143W 1287 nt7.36□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 TIP1YBR067C 633 nt7.36□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 ERG13YML126C 1476 nt7.36□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 CWP2YKL096W-A 279 nt7.35□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 SSL2YIL143C 2532 nt7.35□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 GAL3YDR009W 1563 nt7.34□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 TMA23YMR269W 636 nt7.34□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 LSR1LSR1 1175 nt7.34□□□□□ -1.23
HRD1Q08109 VMA11YPL234C 495 nt7.33□□□□□ -1.24
HRD1Q08109 MDM35YKL053C-A 261 nt7.32□□□□□ -1.24
HRD1Q08109 RRT8YOL048C 1029 nt7.32□□□□□ -1.24
HRD1Q08109 GCD11YER025W 1584 nt7.31□□□□□ -1.24
HRD1Q08109 IMO32YGR031W 1029 nt7.31□□□□□ -1.24
HRD1Q08109 UFD1YGR048W 1086 nt7.31□□□□□ -1.24
HRD1Q08109 YHR218WYHR218W 1812 nt7.31□□□□□ -1.24
HRD1Q08109 ITR2YOL103W 1830 nt7.31□□□□□ -1.24
HRD1Q08109 KRR1YCL059C 951 nt7.3□□□□□ -1.24
HRD1Q08109 YNR029CYNR029C 1290 nt7.3□□□□□ -1.24
HRD1Q08109 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.3□□□□□ -1.24
HRD1Q08109 ADE8YDR408C 645 nt7.28□□□□□ -1.24
HRD1Q08109 YJR114WYJR114W 393 nt7.28□□□□□ -1.24
HRD1Q08109 ADH1YOL086C 1047 nt7.28□□□□□ -1.24
HRD1Q08109 YMR262WYMR262W 942 nt7.27□□□□□ -1.25
HRD1Q08109 SNX3YOR357C 489 nt7.27□□□□□ -1.25
HRD1Q08109 RPC31YNL151C 756 nt7.25□□□□□ -1.25
HRD1Q08109 SAC7YDR389W 1965 nt7.25□□□□□ -1.25
HRD1Q08109 ADE2YOR128C 1716 nt7.24□□□□□ -1.25
HRD1Q08109 DAK2YFL053W 1776 nt7.24□□□□□ -1.25
HRD1Q08109 RPN14YGL004C 1254 nt7.24□□□□□ -1.25
HRD1Q08109 YNR064CYNR064C 873 nt7.24□□□□□ -1.25
HRD1Q08109 HXT10YFL011W 1641 nt7.23□□□□□ -1.25
HRD1Q08109 ELO1YJL196C 933 nt7.22□□□□□ -1.25
HRD1Q08109 YMR265CYMR265C 1386 nt7.21□□□□□ -1.25
HRD1Q08109 KEL3YPL263C 1956 nt7.21□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 INH1YDL181W 258 nt7.21□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 IML3YBR107C 738 nt7.21□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 ECM10YEL030W 1935 nt7.21□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 YJL195CYJL195C 702 nt7.2□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 HAP5YOR358W 729 nt7.2□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 RIM2YBR192W 1134 nt7.2□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 FIT1YDR534C 1587 nt7.2□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 SNU66YOR308C 1764 nt7.19□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 snR31snR31 225 nt7.19□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 CCT5YJR064W 1689 nt7.19□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 TVP23YDR084C 600 nt7.18□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 YPR126CYPR126C 309 nt7.18□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 MAS1YLR163C 1389 nt7.18□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 MET30YIL046W 1923 nt7.17□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.17□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 SPS100YHR139C 981 nt7.17□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 OPI3YJR073C 621 nt7.17□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 MAM3YOL060C 2121 nt7.17□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 SNZ1YMR096W 894 nt7.15□□□□□ -1.26
HRD1Q08109 AGP3YFL055W 1677 nt7.15□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 DPL1YDR294C 1770 nt7.14□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 ENO2YHR174W 1314 nt7.14□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 SUV3YPL029W 2214 nt7.13□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 CTI6YPL181W 1521 nt7.13□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 LEU4YNL104C 1860 nt7.13□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 YDR467CYDR467C 327 nt7.12□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 TAF13YML098W 504 nt7.12□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 ABZ2YMR289W 1125 nt7.12□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 YNL190WYNL190W 615 nt7.12□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 PMA2YPL036W 2844 nt7.11□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 GNP1YDR508C 1992 nt7.1□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 LAS17YOR181W 1902 nt7.1□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 FUN14YAL008W 597 nt7.1□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 MHF1YOL086W-A 273 nt7.1□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 CRC1YOR100C 984 nt7.1□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 YIL177CYIL177C 5277 nt7.1□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 AMF1YOR378W 1548 nt7.1□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 YEL008WYEL008W 381 nt7.09□□□□□ -1.27
HRD1Q08109 SWT21YNL187W 1074 nt7.08□□□□□ -1.28
HRD1Q08109 MET1YKR069W 1782 nt7.08□□□□□ -1.28
HRD1Q08109 NBA1YOL070C 1506 nt7.07□□□□□ -1.28
HRD1Q08109 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 99.7 ms