Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX8Q06710 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX8Q06710 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX8Q06710 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAX8Q06710 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms