Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
TOP2BQ02880 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC45.07■■■■■ 4.8
TOP2BQ02880 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
TOP2BQ02880 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
TOP2BQ02880 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC45.03■■■■■ 4.8
TOP2BQ02880 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
TOP2BQ02880 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
TOP2BQ02880 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
TOP2BQ02880 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
TOP2BQ02880 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
TOP2BQ02880 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
TOP2BQ02880 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC45■■■■■ 4.79
TOP2BQ02880 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
TOP2BQ02880 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
TOP2BQ02880 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
TOP2BQ02880 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
TOP2BQ02880 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
TOP2BQ02880 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
TOP2BQ02880 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
TOP2BQ02880 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
TOP2BQ02880 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
TOP2BQ02880 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
TOP2BQ02880 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
TOP2BQ02880 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
TOP2BQ02880 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
TOP2BQ02880 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
TOP2BQ02880 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
TOP2BQ02880 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
TOP2BQ02880 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
TOP2BQ02880 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
TOP2BQ02880 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
TOP2BQ02880 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
TOP2BQ02880 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
TOP2BQ02880 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
TOP2BQ02880 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
TOP2BQ02880 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
TOP2BQ02880 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
TOP2BQ02880 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC44.79■■■■■ 4.76
TOP2BQ02880 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
TOP2BQ02880 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
TOP2BQ02880 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.78■■■■■ 4.76
TOP2BQ02880 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC44.78■■■■■ 4.76
TOP2BQ02880 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
TOP2BQ02880 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
TOP2BQ02880 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
TOP2BQ02880 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
TOP2BQ02880 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
TOP2BQ02880 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
TOP2BQ02880 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.76
TOP2BQ02880 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
TOP2BQ02880 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
TOP2BQ02880 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
TOP2BQ02880 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
TOP2BQ02880 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
TOP2BQ02880 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
TOP2BQ02880 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
TOP2BQ02880 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
TOP2BQ02880 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
TOP2BQ02880 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
TOP2BQ02880 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
TOP2BQ02880 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
TOP2BQ02880 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
TOP2BQ02880 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
TOP2BQ02880 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
TOP2BQ02880 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
TOP2BQ02880 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
TOP2BQ02880 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
TOP2BQ02880 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
TOP2BQ02880 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
TOP2BQ02880 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
TOP2BQ02880 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
TOP2BQ02880 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
TOP2BQ02880 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
TOP2BQ02880 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
TOP2BQ02880 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
TOP2BQ02880 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
TOP2BQ02880 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
TOP2BQ02880 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
TOP2BQ02880 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
TOP2BQ02880 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC44.57■■■■■ 4.73
TOP2BQ02880 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
TOP2BQ02880 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
TOP2BQ02880 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
TOP2BQ02880 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
TOP2BQ02880 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
TOP2BQ02880 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
TOP2BQ02880 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
TOP2BQ02880 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
TOP2BQ02880 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
TOP2BQ02880 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
TOP2BQ02880 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.49■■■■■ 4.71
TOP2BQ02880 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
TOP2BQ02880 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
TOP2BQ02880 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
TOP2BQ02880 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
TOP2BQ02880 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
TOP2BQ02880 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
TOP2BQ02880 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
TOP2BQ02880 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
TOP2BQ02880 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms