Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CRB1P82279 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CRB1P82279 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CRB1P82279 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CRB1P82279 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CRB1P82279 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CRB1P82279 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CRB1P82279 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CRB1P82279 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CRB1P82279 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CRB1P82279 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CRB1P82279 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CRB1P82279 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CRB1P82279 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CRB1P82279 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CRB1P82279 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CRB1P82279 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CRB1P82279 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CRB1P82279 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CRB1P82279 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CRB1P82279 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CRB1P82279 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CRB1P82279 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CRB1P82279 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CRB1P82279 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CRB1P82279 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CRB1P82279 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CRB1P82279 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CRB1P82279 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CRB1P82279 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CRB1P82279 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CRB1P82279 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CRB1P82279 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CRB1P82279 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CRB1P82279 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CRB1P82279 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CRB1P82279 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CRB1P82279 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CRB1P82279 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CRB1P82279 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CRB1P82279 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CRB1P82279 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CRB1P82279 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CRB1P82279 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CRB1P82279 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CRB1P82279 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CRB1P82279 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CRB1P82279 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CRB1P82279 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CRB1P82279 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CRB1P82279 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CRB1P82279 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CRB1P82279 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CRB1P82279 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CRB1P82279 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CRB1P82279 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CRB1P82279 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CRB1P82279 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CRB1P82279 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CRB1P82279 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CRB1P82279 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CRB1P82279 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CRB1P82279 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CRB1P82279 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CRB1P82279 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CRB1P82279 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CRB1P82279 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CRB1P82279 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CRB1P82279 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CRB1P82279 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CRB1P82279 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CRB1P82279 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CRB1P82279 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CRB1P82279 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CRB1P82279 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CRB1P82279 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CRB1P82279 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CRB1P82279 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CRB1P82279 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CRB1P82279 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CRB1P82279 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CRB1P82279 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CRB1P82279 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CRB1P82279 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CRB1P82279 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CRB1P82279 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CRB1P82279 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CRB1P82279 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CRB1P82279 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CRB1P82279 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CRB1P82279 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CRB1P82279 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CRB1P82279 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CRB1P82279 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CRB1P82279 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CRB1P82279 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CRB1P82279 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CRB1P82279 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CRB1P82279 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CRB1P82279 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms