Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LSM3P62310 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM3P62310 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM3P62310 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM3P62310 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM3P62310 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM3P62310 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM3P62310 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM3P62310 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM3P62310 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM3P62310 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM3P62310 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM3P62310 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM3P62310 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM3P62310 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM3P62310 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM3P62310 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM3P62310 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM3P62310 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM3P62310 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM3P62310 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM3P62310 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSM3P62310 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM3P62310 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM3P62310 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM3P62310 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSM3P62310 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM3P62310 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM3P62310 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM3P62310 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LSM3P62310 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM3P62310 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM3P62310 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM3P62310 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM3P62310 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM3P62310 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM3P62310 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM3P62310 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM3P62310 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM3P62310 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM3P62310 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM3P62310 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM3P62310 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM3P62310 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM3P62310 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM3P62310 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM3P62310 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM3P62310 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM3P62310 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM3P62310 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM3P62310 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM3P62310 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM3P62310 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM3P62310 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM3P62310 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM3P62310 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM3P62310 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM3P62310 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM3P62310 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM3P62310 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM3P62310 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM3P62310 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM3P62310 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSM3P62310 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSM3P62310 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM3P62310 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM3P62310 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM3P62310 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM3P62310 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM3P62310 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM3P62310 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM3P62310 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM3P62310 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM3P62310 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM3P62310 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM3P62310 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM3P62310 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM3P62310 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM3P62310 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM3P62310 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM3P62310 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM3P62310 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM3P62310 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM3P62310 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM3P62310 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM3P62310 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM3P62310 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM3P62310 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM3P62310 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM3P62310 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM3P62310 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM3P62310 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM3P62310 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM3P62310 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM3P62310 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM3P62310 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM3P62310 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM3P62310 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM3P62310 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM3P62310 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms