Protein–RNA interactions for Protein: P61086

UBE2K, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2KP61086 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2KP61086 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2KP61086 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2KP61086 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2KP61086 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2KP61086 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2KP61086 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2KP61086 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2KP61086 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2KP61086 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2KP61086 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2KP61086 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2KP61086 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2KP61086 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2KP61086 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2KP61086 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2KP61086 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2KP61086 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2KP61086 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2KP61086 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2KP61086 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2KP61086 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2KP61086 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2KP61086 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2KP61086 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2KP61086 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2KP61086 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2KP61086 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2KP61086 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2KP61086 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2KP61086 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2KP61086 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2KP61086 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2KP61086 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2KP61086 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2KP61086 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2KP61086 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2KP61086 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2KP61086 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2KP61086 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2KP61086 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2KP61086 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms