Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5EP56381 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5EP56381 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5EP56381 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5EP56381 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.7 ms