Protein–RNA interactions for Protein: P53849

GIS2, Zinc finger protein GIS2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIS2P53849 YPR126CYPR126C 309 nt6.03□□□□□ -1.44
GIS2P53849 SSN3YPL042C 1668 nt6.02□□□□□ -1.45
GIS2P53849 YDL086WYDL086W 822 nt6.02□□□□□ -1.45
GIS2P53849 OXA1YER154W 1209 nt6.02□□□□□ -1.45
GIS2P53849 IGD1YFR017C 588 nt6.02□□□□□ -1.45
GIS2P53849 IML3YBR107C 738 nt6.02□□□□□ -1.45
GIS2P53849 ZAP1YJL056C 2643 nt6.02□□□□□ -1.45
GIS2P53849 YMR209CYMR209C 1374 nt6.02□□□□□ -1.45
GIS2P53849 APS2YJR058C 444 nt6.01□□□□□ -1.45 RIP-Chip
GIS2P53849 YMR007WYMR007W 381 nt6.01□□□□□ -1.45
GIS2P53849 SNZ1YMR096W 894 nt6.01□□□□□ -1.45
GIS2P53849 YOR268CYOR268C 399 nt6.01□□□□□ -1.45
GIS2P53849 MFG1YDL233W 1377 nt6.01□□□□□ -1.45
GIS2P53849 CTI6YPL181W 1521 nt6□□□□□ -1.45 RIP-Chip
GIS2P53849 ACO2YJL200C 2370 nt6□□□□□ -1.45
GIS2P53849 HEM13YDR044W 987 nt6□□□□□ -1.45
GIS2P53849 SWM1YDR260C 513 nt6□□□□□ -1.45
GIS2P53849 BNI5YNL166C 1347 nt5.99□□□□□ -1.45
GIS2P53849 MAE1YKL029C 2010 nt5.99□□□□□ -1.45
GIS2P53849 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt5.99□□□□□ -1.45
GIS2P53849 MSC1YML128C 1542 nt5.99□□□□□ -1.45
GIS2P53849 NIF3YGL221C 867 nt5.98□□□□□ -1.45
GIS2P53849 REG2YBR050C 1017 nt5.98□□□□□ -1.45
GIS2P53849 IPL1YPL209C 1104 nt5.98□□□□□ -1.45
GIS2P53849 FUB1YCR076C 753 nt5.97□□□□□ -1.45 RIP-Chip
GIS2P53849 YER188WYER188W 720 nt5.97□□□□□ -1.45
GIS2P53849 PHO23YNL097C 993 nt5.97□□□□□ -1.45
GIS2P53849 DIG1YPL049C 1359 nt5.96□□□□□ -1.45
GIS2P53849 DAK2YFL053W 1776 nt5.96□□□□□ -1.46
GIS2P53849 GID8YMR135C 1368 nt5.95□□□□□ -1.46
GIS2P53849 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt5.95□□□□□ -1.46
GIS2P53849 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt5.95□□□□□ -1.46
GIS2P53849 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt5.95□□□□□ -1.46
GIS2P53849 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt5.95□□□□□ -1.46
GIS2P53849 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt5.95□□□□□ -1.46
GIS2P53849 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt5.95□□□□□ -1.46
GIS2P53849 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt5.95□□□□□ -1.46
GIS2P53849 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt5.95□□□□□ -1.46
GIS2P53849 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt5.95□□□□□ -1.46
GIS2P53849 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt5.95□□□□□ -1.46
GIS2P53849 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt5.95□□□□□ -1.46
GIS2P53849 HRA1HRA1 564 nt5.95□□□□□ -1.46
GIS2P53849 SAM3YPL274W 1764 nt5.94□□□□□ -1.46
GIS2P53849 OSH7YHR001W 1314 nt5.94□□□□□ -1.46
GIS2P53849 HOG1YLR113W 1308 nt5.93□□□□□ -1.46
GIS2P53849 TAT2YOL020W 1779 nt5.93□□□□□ -1.46
GIS2P53849 MRS6YOR370C 1812 nt5.92□□□□□ -1.46
GIS2P53849 RAS2YNL098C 969 nt5.92□□□□□ -1.46 RIP-Chip
GIS2P53849 YKL133CYKL133C 1392 nt5.92□□□□□ -1.46
GIS2P53849 OYE2YHR179W 1203 nt5.91□□□□□ -1.46
GIS2P53849 YHR219WYHR219W 1875 nt5.9□□□□□ -1.46 RIP-Chip
GIS2P53849 LYS20YDL182W 1287 nt5.9□□□□□ -1.46
GIS2P53849 ODC1YPL134C 933 nt5.9□□□□□ -1.46
GIS2P53849 PSD1YNL169C 1503 nt5.89□□□□□ -1.47
GIS2P53849 DMA2YNL116W 1569 nt5.89□□□□□ -1.47
GIS2P53849 SOL2YCR073W-A 948 nt5.89□□□□□ -1.47 RIP-Chip
GIS2P53849 FLX1YIL134W 936 nt5.89□□□□□ -1.47
GIS2P53849 AIM1YAL046C 357 nt5.89□□□□□ -1.47
GIS2P53849 SSL2YIL143C 2532 nt5.89□□□□□ -1.47
GIS2P53849 TPS1YBR126C 1488 nt5.89□□□□□ -1.47
GIS2P53849 EDC2YER035W 438 nt5.88□□□□□ -1.47
GIS2P53849 CYT1YOR065W 930 nt5.87□□□□□ -1.47
GIS2P53849 GRH1YDR517W 1119 nt5.86□□□□□ -1.47
GIS2P53849 YLR046CYLR046C 813 nt5.86□□□□□ -1.47 RIP-Chip
GIS2P53849 ASP3-1YLR155C 1089 nt5.86□□□□□ -1.47
GIS2P53849 ASP3-2YLR157C 1089 nt5.86□□□□□ -1.47
GIS2P53849 ASP3-3YLR158C 1089 nt5.86□□□□□ -1.47
GIS2P53849 ASP3-4YLR160C 1089 nt5.86□□□□□ -1.47
GIS2P53849 HTS1YPR033C 1641 nt5.85□□□□□ -1.47
GIS2P53849 DLD3YEL071W 1491 nt5.85□□□□□ -1.47
GIS2P53849 YDR455CYDR455C 309 nt5.85□□□□□ -1.47
GIS2P53849 SER2YGR208W 930 nt5.85□□□□□ -1.47
GIS2P53849 ENT4YLL038C 744 nt5.85□□□□□ -1.47 RIP-Chip
GIS2P53849 BUR6YER159C 429 nt5.84□□□□□ -1.47 RIP-Chip
GIS2P53849 EAF3YPR023C 1206 nt5.84□□□□□ -1.47 RIP-Chip
GIS2P53849 SPS100YHR139C 981 nt5.83□□□□□ -1.48
GIS2P53849 CYC3YAL039C 810 nt5.83□□□□□ -1.48
GIS2P53849 CDD1YLR245C 429 nt5.83□□□□□ -1.48
GIS2P53849 YMR206WYMR206W 942 nt5.83□□□□□ -1.48 RIP-Chip
GIS2P53849 FSH2YMR222C 672 nt5.83□□□□□ -1.48
GIS2P53849 LSR1LSR1 1175 nt5.83□□□□□ -1.48
GIS2P53849 THP3YPR045C 1413 nt5.82□□□□□ -1.48
GIS2P53849 LSM5YER146W 282 nt5.82□□□□□ -1.48 RIP-Chip
GIS2P53849 TMA23YMR269W 636 nt5.82□□□□□ -1.48 RIP-Chip
GIS2P53849 YHR218WYHR218W 1812 nt5.82□□□□□ -1.48 RIP-Chip
GIS2P53849 ITR2YOL103W 1830 nt5.81□□□□□ -1.48
GIS2P53849 RPD3YNL330C 1302 nt5.81□□□□□ -1.48 RIP-Chip
GIS2P53849 PCP1YGR101W 1041 nt5.81□□□□□ -1.48
GIS2P53849 MDM35YKL053C-A 261 nt5.81□□□□□ -1.48 RIP-Chip
GIS2P53849 CWP2YKL096W-A 279 nt5.81□□□□□ -1.48
GIS2P53849 MET8YBR213W 825 nt5.81□□□□□ -1.48
GIS2P53849 YHL008CYHL008C 1884 nt5.81□□□□□ -1.48
GIS2P53849 NAS2YIL007C 663 nt5.8□□□□□ -1.48
GIS2P53849 ERG13YML126C 1476 nt5.79□□□□□ -1.48
GIS2P53849 MRP1YDR347W 966 nt5.79□□□□□ -1.48
GIS2P53849 Q0010Q0010 387 nt5.79□□□□□ -1.48
GIS2P53849 HXT10YFL011W 1641 nt5.78□□□□□ -1.48
GIS2P53849 DDI1YER143W 1287 nt5.78□□□□□ -1.48
GIS2P53849 IMO32YGR031W 1029 nt5.78□□□□□ -1.48 RIP-Chip
GIS2P53849 ARA2YMR041C 1008 nt5.77□□□□□ -1.49
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