Protein–RNA interactions for Protein: P53314

CPD1, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, yeastyeast

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1P53314 SAM3YPL274W 1764 nt7.16□□□□□ -1.26
CPD1P53314 CWP2YKL096W-A 279 nt7.16□□□□□ -1.26
CPD1P53314 RAS2YNL098C 969 nt7.16□□□□□ -1.26
CPD1P53314 RIB7YBR153W 735 nt7.16□□□□□ -1.26
CPD1P53314 RIB2YOL066C 1776 nt7.15□□□□□ -1.26
CPD1P53314 YOR072WYOR072W 315 nt7.15□□□□□ -1.26
CPD1P53314 YJL055WYJL055W 738 nt7.14□□□□□ -1.27
CPD1P53314 Q0010Q0010 387 nt7.14□□□□□ -1.27
CPD1P53314 OYE2YHR179W 1203 nt7.13□□□□□ -1.27
CPD1P53314 AGP3YFL055W 1677 nt7.12□□□□□ -1.27
CPD1P53314 SOL2YCR073W-A 948 nt7.12□□□□□ -1.27
CPD1P53314 PCP1YGR101W 1041 nt7.12□□□□□ -1.27
CPD1P53314 YJL195CYJL195C 702 nt7.12□□□□□ -1.27
CPD1P53314 ENT4YLL038C 744 nt7.12□□□□□ -1.27
CPD1P53314 ITR2YOL103W 1830 nt7.12□□□□□ -1.27
CPD1P53314 GAL3YDR009W 1563 nt7.12□□□□□ -1.27
CPD1P53314 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.11□□□□□ -1.27
CPD1P53314 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.11□□□□□ -1.27
CPD1P53314 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.11□□□□□ -1.27
CPD1P53314 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.11□□□□□ -1.27
CPD1P53314 EAF3YPR023C 1206 nt7.11□□□□□ -1.27
CPD1P53314 TOK1YJL093C 2076 nt7.1□□□□□ -1.27
CPD1P53314 FUN14YAL008W 597 nt7.1□□□□□ -1.27
CPD1P53314 YMR262WYMR262W 942 nt7.1□□□□□ -1.27
CPD1P53314 GPN2YOR262W 1044 nt7.09□□□□□ -1.27
CPD1P53314 TIP1YBR067C 633 nt7.09□□□□□ -1.27
CPD1P53314 NBA1YOL070C 1506 nt7.09□□□□□ -1.27
CPD1P53314 TPS1YBR126C 1488 nt7.08□□□□□ -1.28
CPD1P53314 MEX67YPL169C 1800 nt7.08□□□□□ -1.28
CPD1P53314 YRF1-2YER190W 5046 nt7.08□□□□□ -1.28
CPD1P53314 FRA1YLL029W 2250 nt7.05□□□□□ -1.28
CPD1P53314 YDR455CYDR455C 309 nt7.05□□□□□ -1.28
CPD1P53314 YEL008WYEL008W 381 nt7.05□□□□□ -1.28
CPD1P53314 RPC31YNL151C 756 nt7.05□□□□□ -1.28
CPD1P53314 VMA11YPL234C 495 nt7.05□□□□□ -1.28
CPD1P53314 RIM2YBR192W 1134 nt7.05□□□□□ -1.28
CPD1P53314 DPL1YDR294C 1770 nt7.05□□□□□ -1.28
CPD1P53314 CCT5YJR064W 1689 nt7.04□□□□□ -1.28
CPD1P53314 SNX3YOR357C 489 nt7.04□□□□□ -1.28
CPD1P53314 LEU4YNL104C 1860 nt7.03□□□□□ -1.28
CPD1P53314 TMA23YMR269W 636 nt7.03□□□□□ -1.28
CPD1P53314 THI72YOR192C 1800 nt7.02□□□□□ -1.29
CPD1P53314 INH1YDL181W 258 nt7.02□□□□□ -1.29
CPD1P53314 LSM5YER146W 282 nt7.02□□□□□ -1.29
CPD1P53314 RRT8YOL048C 1029 nt7.01□□□□□ -1.29
CPD1P53314 DAK2YFL053W 1776 nt7□□□□□ -1.29
CPD1P53314 IMO32YGR031W 1029 nt7□□□□□ -1.29
CPD1P53314 ERG13YML126C 1476 nt6.99□□□□□ -1.29
CPD1P53314 KRR1YCL059C 951 nt6.99□□□□□ -1.29
CPD1P53314 DDI1YER143W 1287 nt6.99□□□□□ -1.29
CPD1P53314 STE4YOR212W 1272 nt6.99□□□□□ -1.29
CPD1P53314 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 YPR126CYPR126C 309 nt6.98□□□□□ -1.29
CPD1P53314 SAC7YDR389W 1965 nt6.97□□□□□ -1.29
CPD1P53314 FET5YFL041W 1869 nt6.97□□□□□ -1.29
CPD1P53314 MIM1YOL026C 342 nt6.97□□□□□ -1.29
CPD1P53314 MDL2YPL270W 2322 nt6.97□□□□□ -1.29
CPD1P53314 NPP2YEL016C 1482 nt6.97□□□□□ -1.29
CPD1P53314 SNZ1YMR096W 894 nt6.96□□□□□ -1.3
CPD1P53314 YJR154WYJR154W 1041 nt6.95□□□□□ -1.3
CPD1P53314 YLR349WYLR349W 507 nt6.95□□□□□ -1.3
CPD1P53314 IML3YBR107C 738 nt6.95□□□□□ -1.3
CPD1P53314 YDR467CYDR467C 327 nt6.93□□□□□ -1.3
CPD1P53314 ELO1YJL196C 933 nt6.93□□□□□ -1.3
CPD1P53314 TAF13YML098W 504 nt6.93□□□□□ -1.3
CPD1P53314 NSG2YNL156C 900 nt6.93□□□□□ -1.3
CPD1P53314 MHF1YOL086W-A 273 nt6.93□□□□□ -1.3
CPD1P53314 ADE8YDR408C 645 nt6.91□□□□□ -1.3
CPD1P53314 CTI6YPL181W 1521 nt6.91□□□□□ -1.3
CPD1P53314 HBS1YKR084C 1836 nt6.9□□□□□ -1.3
CPD1P53314 CPD1YGR247W 720 nt6.9□□□□□ -1.3
CPD1P53314 YJR114WYJR114W 393 nt6.9□□□□□ -1.3
CPD1P53314 SPS100YHR139C 981 nt6.89□□□□□ -1.31
CPD1P53314 YMR265CYMR265C 1386 nt6.89□□□□□ -1.31
CPD1P53314 TRP2YER090W 1524 nt6.89□□□□□ -1.31
CPD1P53314 TVP23YDR084C 600 nt6.88□□□□□ -1.31
CPD1P53314 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt6.88□□□□□ -1.31
CPD1P53314 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt6.88□□□□□ -1.31
CPD1P53314 DUR3YHL016C 2208 nt6.88□□□□□ -1.31
CPD1P53314 SUV3YPL029W 2214 nt6.88□□□□□ -1.31
CPD1P53314 MTO1YGL236C 2010 nt6.88□□□□□ -1.31
CPD1P53314 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt6.87□□□□□ -1.31
CPD1P53314 HAP5YOR358W 729 nt6.87□□□□□ -1.31
CPD1P53314 RPN14YGL004C 1254 nt6.86□□□□□ -1.31
CPD1P53314 POT1YIL160C 1254 nt6.86□□□□□ -1.31
CPD1P53314 YNR064CYNR064C 873 nt6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms