Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-5P52952 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-5P52952 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-5P52952 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NKX2-5P52952 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-5P52952 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-5P52952 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-5P52952 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-5P52952 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-5P52952 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-5P52952 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-5P52952 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-5P52952 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-5P52952 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms