Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THOP1P52888 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THOP1P52888 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THOP1P52888 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THOP1P52888 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THOP1P52888 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THOP1P52888 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THOP1P52888 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THOP1P52888 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THOP1P52888 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THOP1P52888 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THOP1P52888 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THOP1P52888 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THOP1P52888 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THOP1P52888 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THOP1P52888 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THOP1P52888 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THOP1P52888 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THOP1P52888 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THOP1P52888 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
THOP1P52888 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THOP1P52888 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THOP1P52888 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
THOP1P52888 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THOP1P52888 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
THOP1P52888 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
THOP1P52888 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
THOP1P52888 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
THOP1P52888 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
THOP1P52888 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
THOP1P52888 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
THOP1P52888 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
THOP1P52888 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
THOP1P52888 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
THOP1P52888 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
THOP1P52888 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
THOP1P52888 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
THOP1P52888 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
THOP1P52888 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
THOP1P52888 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
THOP1P52888 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
THOP1P52888 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
THOP1P52888 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
THOP1P52888 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
THOP1P52888 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
THOP1P52888 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
THOP1P52888 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
THOP1P52888 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
THOP1P52888 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
THOP1P52888 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
THOP1P52888 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
THOP1P52888 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
THOP1P52888 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
THOP1P52888 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
THOP1P52888 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
THOP1P52888 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
THOP1P52888 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
THOP1P52888 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
THOP1P52888 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
THOP1P52888 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THOP1P52888 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
THOP1P52888 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THOP1P52888 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THOP1P52888 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THOP1P52888 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THOP1P52888 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
THOP1P52888 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THOP1P52888 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
THOP1P52888 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
THOP1P52888 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
THOP1P52888 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
THOP1P52888 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
THOP1P52888 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
THOP1P52888 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
THOP1P52888 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
THOP1P52888 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
THOP1P52888 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
THOP1P52888 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
THOP1P52888 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
THOP1P52888 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
THOP1P52888 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
THOP1P52888 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
THOP1P52888 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
THOP1P52888 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
THOP1P52888 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
THOP1P52888 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
THOP1P52888 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
THOP1P52888 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
THOP1P52888 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
THOP1P52888 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
THOP1P52888 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
THOP1P52888 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
THOP1P52888 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
THOP1P52888 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
THOP1P52888 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
THOP1P52888 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
THOP1P52888 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
THOP1P52888 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
THOP1P52888 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
THOP1P52888 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms