Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 NLRP1-210ENST00000572272 4422 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 NLRP1-204ENST00000354411 4332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 NLRP1-207ENST00000571307 4050 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-10■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.332e-10■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.582e-10■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 ARID2-208ENST00000479608 7761 ntTSL 1 (best)4.62□□□□□ -1.672e-10■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.872e-10■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 PANK2-205ENST00000495692 967 ntTSL 330.59■■■□□ 2.499e-10■■■■■ 42.3
HNRNPMP52272 ORC4-213ENST00000496670 645 ntTSL 54.73□□□□□ -1.652e-7■■■■■ 42.3
HNRNPMP52272 COG5-208ENST00000475638 592 ntTSL 35.3□□□□□ -1.565e-7■■■■■ 42.3
HNRNPMP52272 RPS4Y1-202ENST00000430575 811 ntTSL 39.22□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 42.2
HNRNPMP52272 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 42.2
HNRNPMP52272 SNX13-206ENST00000474067 603 ntTSL 332.24■■■□□ 2.758e-7■■■■■ 42.1
HNRNPMP52272 SNX13-205ENST00000471744 454 ntTSL 423.39■■□□□ 1.338e-7■■■■■ 42.1
HNRNPMP52272 SNX13-207ENST00000475800 507 ntTSL 423.39■■□□□ 1.338e-7■■■■■ 42.1
HNRNPMP52272 SNX13-204ENST00000444712 2018 ntTSL 522.5■■□□□ 1.198e-7■■■■■ 42.1
HNRNPMP52272 SNX13-202ENST00000409604 4146 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.178e-7■■■■■ 42.1
HNRNPMP52272 SNX13-203ENST00000428135 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.368e-7■■■■■ 42.1
HNRNPMP52272 SNX13-201ENST00000409076 3818 ntTSL 211.11□□□□□ -0.638e-7■■■■■ 42.1
HNRNPMP52272 SNX13-208ENST00000482558 1139 ntTSL 210.55□□□□□ -0.728e-7■■■■■ 42.1
HNRNPMP52272 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.038e-7■■■■■ 42.1
HNRNPMP52272 SUN1-229ENST00000475971 4038 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 42.1
HNRNPMP52272 OSBPL8-207ENST00000548341 542 ntTSL 43.75□□□□□ -1.811e-12■■■■■ 42
HNRNPMP52272 TANGO2-208ENST00000430807 733 ntTSL 335.95■■■■□ 3.359e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.319e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.29e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 TANGO2-206ENST00000411907 568 ntTSL 434.67■■■■□ 3.149e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.129e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 TANGO2-215ENST00000450019 1689 ntTSL 534.44■■■■□ 3.19e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.789e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.749e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.719e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.589e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 TANGO2-211ENST00000434168 862 ntTSL 330.18■■■□□ 2.429e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.249e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 TANGO2-216ENST00000450664 570 ntTSL 428.62■■■□□ 2.179e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 TANGO2-203ENST00000399807 2241 ntTSL 526.12■■□□□ 1.779e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.259e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 GET4-205ENST00000441491 682 ntTSL 524.28■■□□□ 1.485e-9■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.565e-9■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.059e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 SLF1-203ENST00000466957 593 ntTSL 56.93□□□□□ -1.39e-7■■■■■ 41.8
HNRNPMP52272 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.298e-11■■■■■ 41.7
HNRNPMP52272 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.048e-11■■■■■ 41.7
HNRNPMP52272 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.638e-11■■■■■ 41.7
HNRNPMP52272 HIBCH-209ENST00000416732 502 ntTSL 25.7□□□□□ -1.58e-11■■■■■ 41.7
HNRNPMP52272 HIBCH-205ENST00000409820 511 ntTSL 35.44□□□□□ -1.548e-11■■■■■ 41.7
HNRNPMP52272 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.488e-11■■■■■ 41.7
HNRNPMP52272 C2orf48-202ENST00000619640 480 ntTSL 1 (best)23.78■■□□□ 1.48e-11■■■■■ 41.7
HNRNPMP52272 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.918e-11■■■■■ 41.7
HNRNPMP52272 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.348e-11■■■■■ 41.7
HNRNPMP52272 DEAF1-211ENST00000529727 248 ntTSL 311.42□□□□□ -0.588e-11■■■■■ 41.7
HNRNPMP52272 BRF1-212ENST00000547562 2405 ntTSL 221.66■■□□□ 1.062e-17■■■■■ 41.6
HNRNPMP52272 PELP1-203ENST00000570387 567 ntTSL 512.64□□□□□ -0.393e-7■■■■■ 41.6
HNRNPMP52272 CMSS1-202ENST00000463526 397 ntTSL 324.81■■□□□ 1.567e-7■■■■■ 41.5
HNRNPMP52272 CMSS1-208ENST00000496116 2145 ntTSL 1 (best)15.44■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 41.5
HNRNPMP52272 CMSS1-201ENST00000421999 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.237e-7■■■■■ 41.5
HNRNPMP52272 CMSS1-206ENST00000491299 881 ntTSL 513.44□□□□□ -0.267e-7■■■■■ 41.5
HNRNPMP52272 MAD1L1-219ENST00000481633 548 ntTSL 222.36■■□□□ 1.173e-7■■■■■ 41.5
HNRNPMP52272 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.032e-12■■■■■ 41.4
HNRNPMP52272 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 429.84■■■□□ 2.372e-12■■■■■ 41.4
HNRNPMP52272 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.142e-12■■■■■ 41.4
HNRNPMP52272 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.782e-12■■■■■ 41.4
HNRNPMP52272 SBNO2-205ENST00000587655 914 ntTSL 325.74■■□□□ 1.712e-12■■■■■ 41.4
HNRNPMP52272 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.452e-12■■■■■ 41.4
HNRNPMP52272 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 219.38■□□□□ 0.697e-7■■■■■ 41.4
HNRNPMP52272 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.892e-7■■■■■ 41.3
HNRNPMP52272 PANK2-202ENST00000336066 1843 ntTSL 1 (best)36.94■■■■□ 3.52e-7■■■■■ 41.3
HNRNPMP52272 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.542e-7■■■■■ 41.3
HNRNPMP52272 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.562e-7■■■■■ 41.3
HNRNPMP52272 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 41.3
HNRNPMP52272 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.952e-11■■■■■ 41.3
HNRNPMP52272 SRP54-AS1-202ENST00000555015 561 ntTSL 319.99■□□□□ 0.792e-11■■■■■ 41.3
HNRNPMP52272 SRP54-AS1-205ENST00000636540 565 ntBASIC17.48■□□□□ 0.392e-11■■■■■ 41.3
HNRNPMP52272 SRP54-AS1-201ENST00000554945 600 ntTSL 315.2■□□□□ 0.022e-11■■■■■ 41.3
HNRNPMP52272 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.632e-11■■■■■ 41.3
HNRNPMP52272 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.145e-7■■■■■ 41.2
HNRNPMP52272 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.44e-7■■■■■ 41.2
HNRNPMP52272 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 433.75■■■□□ 2.994e-7■■■■■ 41.2
HNRNPMP52272 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 333.75■■■□□ 2.994e-7■■■■■ 41.2
HNRNPMP52272 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 328.91■■■□□ 2.224e-7■■■■■ 41.2
HNRNPMP52272 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 527.46■■□□□ 1.994e-7■■■■■ 41.2
HNRNPMP52272 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 226.72■■□□□ 1.874e-7■■■■■ 41.2
HNRNPMP52272 AP2A2-216ENST00000529438 572 ntTSL 427.43■■□□□ 1.983e-7■■■■■ 41
HNRNPMP52272 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.947e-7■■■■■ 41
HNRNPMP52272 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.747e-7■■■■■ 41
HNRNPMP52272 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.497e-7■■■■■ 41
HNRNPMP52272 DNAAF5-203ENST00000437419 585 ntTSL 531.39■■■□□ 2.626e-7■■■■■ 41
HNRNPMP52272 DNAAF5-204ENST00000438961 579 ntTSL 430.05■■■□□ 2.46e-7■■■■■ 41
HNRNPMP52272 DNAAF5-205ENST00000440747 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.75■■□□□ 1.076e-7■■■■■ 41
HNRNPMP52272 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.966e-7■■■■■ 41
HNRNPMP52272 AIG1-204ENST00000367601 727 ntTSL 520.63■□□□□ 0.897e-7■■■■■ 40.9
HNRNPMP52272 AIG1-205ENST00000447498 444 ntTSL 519.26■□□□□ 0.677e-7■■■■■ 40.9
HNRNPMP52272 AIG1-202ENST00000357847 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -07e-7■■■■■ 40.9
HNRNPMP52272 AIG1-201ENST00000275235 1202 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.197e-7■■■■■ 40.9
HNRNPMP52272 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.617e-7■■■■■ 40.9
HNRNPMP52272 AIG1-206ENST00000458219 593 ntTSL 210.59□□□□□ -0.717e-7■■■■■ 40.9
HNRNPMP52272 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.997e-7■■■■■ 40.9
HNRNPMP52272 AIG1-207ENST00000470265 572 ntTSL 24.83□□□□□ -1.647e-7■■■■■ 40.9
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 536.7 ms