Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.841e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 RNH1-213ENST00000528713 1202 ntTSL 1 (best)20.3■□□□□ 0.841e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 LTK-205ENST00000563518 3444 ntTSL 219.82■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 RNH1-207ENST00000524464 624 ntTSL 519.55■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 ASPSCR1-216ENST00000583503 641 ntTSL 319.45■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 ASPSCR1-209ENST00000581484 1001 ntTSL 218.61■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 69.8
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AARSP49588 RNH1-218ENST00000531149 709 ntTSL 316.87■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 216.82■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 METTL12-202ENST00000529868 2870 ntTSL 1 (best)16.68■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 RNH1-212ENST00000527485 873 ntTSL 216.6■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 RNH1-215ENST00000529306 870 ntTSL 316.6■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 AC004922.1-202ENST00000441989 1702 ntTSL 216.59■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 GALNS-209ENST00000567525 1953 ntTSL 216.49■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 RNH1-214ENST00000529115 855 ntTSL 316.39■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 ALG8-208ENST00000526737 1674 ntTSL 516.01■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 ALG8-211ENST00000527099 829 ntTSL 415.55■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 ARPC1A-202ENST00000432786 1516 ntTSL 515.46■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 SLC12A7-206ENST00000634447 3142 ntTSL 515.08■□□□□ 01e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 RNH1-208ENST00000524780 1059 ntTSL 214.55□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 RNH1-209ENST00000525522 3281 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 FBF1-202ENST00000585990 4481 ntTSL 214.09□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 GALNS-212ENST00000568613 1804 ntTSL 213.97□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 METTL12-201ENST00000398922 1368 ntTSL 413.83□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 ALG8-201ENST00000299626 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 FBF1-201ENST00000319129 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.34□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 AC087289.3-202ENST00000593156 4270 ntTSL 213.27□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 SLC48A1-202ENST00000442892 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 FBF1-212ENST00000636174 3626 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 AGO2-209ENST00000523609 3050 ntTSL 1 (best)12.91□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 XPO6-208ENST00000565698 4255 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 69.8
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AARSP49588 ALG8-213ENST00000530454 881 ntTSL 511.91□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 ARPC1A-203ENST00000463009 719 ntTSL 311.75□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 69.8
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AARSP49588 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 69.8
AARSP49588 SARS-203ENST00000468588 1582 ntTSL 25.14□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 69.8
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AARSP49588 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.439e-9■■■■■ 69.5
AARSP49588 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.899e-9■■■■■ 69.5
AARSP49588 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.079e-9■■■■■ 69.5
AARSP49588 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.239e-9■■■■■ 69.5
AARSP49588 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.289e-9■■■■■ 69.5
AARSP49588 RAP1GAP-203ENST00000374757 1328 ntTSL 526.39■■□□□ 1.821e-6■■■■■ 68.7
AARSP49588 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 68.7
AARSP49588 RAP1GAP-209ENST00000471600 3238 ntTSL 512.96□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 68.7
AARSP49588 RAP1GAP-207ENST00000447293 429 ntTSL 212.83□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 68.7
AARSP49588 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.13e-6■■■■■ 67
AARSP49588 ASMTL-AS1-201ENST00000419737 553 ntTSL 214.5□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 67
AARSP49588 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 67
AARSP49588 ASMTL-AS1-202ENST00000420411 697 ntTSL 1 (best)11.93□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 67
AARSP49588 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.352e-6■■■■■ 67
AARSP49588 ZYX-205ENST00000446634 926 ntTSL 520.52■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 67
AARSP49588 ZYX-204ENST00000436448 632 ntTSL 419.53■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 67
AARSP49588 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 218.89■□□□□ 0.612e-12■■■■■ 67
AARSP49588 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 516.92■□□□□ 0.32e-12■■■■■ 67
AARSP49588 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 67
AARSP49588 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.232e-12■■■■■ 67
AARSP49588 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.232e-12■■■■■ 67
AARSP49588 ZYX-202ENST00000354434 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.27■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 67
AARSP49588 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 67
AARSP49588 MSH5-206ENST00000423982 2706 ntTSL 516.03■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 67
AARSP49588 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 215.92■□□□□ 0.142e-12■■■■■ 67
AARSP49588 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 215.64■□□□□ 0.092e-12■■■■■ 67
AARSP49588 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 67
AARSP49588 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)14.69□□□□□ -0.062e-12■■■■■ 67
AARSP49588 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 67
AARSP49588 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 67
AARSP49588 MSH5-209ENST00000450148 1000 ntTSL 513.47□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 67
AARSP49588 MSH5-211ENST00000463144 2296 ntTSL 510.87□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 67
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