Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPIAP49247 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPIAP49247 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPIAP49247 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPIAP49247 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RPIAP49247 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPIAP49247 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPIAP49247 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPIAP49247 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPIAP49247 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPIAP49247 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPIAP49247 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPIAP49247 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPIAP49247 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPIAP49247 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPIAP49247 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPIAP49247 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPIAP49247 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPIAP49247 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPIAP49247 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPIAP49247 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPIAP49247 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPIAP49247 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPIAP49247 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPIAP49247 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RPIAP49247 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPIAP49247 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPIAP49247 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPIAP49247 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPIAP49247 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPIAP49247 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPIAP49247 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPIAP49247 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPIAP49247 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RPIAP49247 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPIAP49247 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPIAP49247 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPIAP49247 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPIAP49247 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPIAP49247 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPIAP49247 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPIAP49247 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPIAP49247 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPIAP49247 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPIAP49247 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPIAP49247 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPIAP49247 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPIAP49247 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPIAP49247 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPIAP49247 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPIAP49247 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPIAP49247 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RPIAP49247 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPIAP49247 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPIAP49247 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPIAP49247 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPIAP49247 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPIAP49247 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPIAP49247 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPIAP49247 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPIAP49247 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPIAP49247 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RPIAP49247 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPIAP49247 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPIAP49247 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RPIAP49247 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPIAP49247 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPIAP49247 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPIAP49247 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPIAP49247 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPIAP49247 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPIAP49247 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPIAP49247 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPIAP49247 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPIAP49247 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPIAP49247 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPIAP49247 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPIAP49247 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPIAP49247 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPIAP49247 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPIAP49247 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPIAP49247 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPIAP49247 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPIAP49247 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPIAP49247 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPIAP49247 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPIAP49247 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPIAP49247 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RPIAP49247 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPIAP49247 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPIAP49247 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPIAP49247 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RPIAP49247 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPIAP49247 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPIAP49247 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPIAP49247 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPIAP49247 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPIAP49247 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPIAP49247 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPIAP49247 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms