Protein–RNA interactions for Protein: P48567

PUS4, tRNA pseudouridine synthase 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS4P48567 GID8YMR135C 1368 nt7.67□□□□□ -1.18
PUS4P48567 REC114YMR133W 1287 nt7.66□□□□□ -1.18
PUS4P48567 KDX1YKL161C 1302 nt7.65□□□□□ -1.18
PUS4P48567 BRR1YPR057W 1026 nt7.65□□□□□ -1.18
PUS4P48567 ARO7YPR060C 771 nt7.65□□□□□ -1.18
PUS4P48567 OXA1YER154W 1209 nt7.64□□□□□ -1.19
PUS4P48567 YPI1YFR003C 468 nt7.64□□□□□ -1.19
PUS4P48567 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.64□□□□□ -1.19
PUS4P48567 TOA2YKL058W 369 nt7.64□□□□□ -1.19
PUS4P48567 YNL165WYNL165W 1221 nt7.64□□□□□ -1.19
PUS4P48567 YKR023WYKR023W 1593 nt7.63□□□□□ -1.19
PUS4P48567 SEC61YLR378C 1443 nt7.62□□□□□ -1.19
PUS4P48567 YKL133CYKL133C 1392 nt7.62□□□□□ -1.19
PUS4P48567 SAM2YDR502C 1155 nt7.62□□□□□ -1.19
PUS4P48567 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.62□□□□□ -1.19
PUS4P48567 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.62□□□□□ -1.19
PUS4P48567 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.62□□□□□ -1.19
PUS4P48567 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.62□□□□□ -1.19
PUS4P48567 OYE3YPL171C 1203 nt7.62□□□□□ -1.19
PUS4P48567 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.62□□□□□ -1.19
PUS4P48567 DUR3YHL016C 2208 nt7.62□□□□□ -1.19
PUS4P48567 CWP2YKL096W-A 279 nt7.61□□□□□ -1.19
PUS4P48567 YPL251WYPL251W 303 nt7.61□□□□□ -1.19
PUS4P48567 MIM1YOL026C 342 nt7.6□□□□□ -1.19
PUS4P48567 SPP2YOR148C 558 nt7.6□□□□□ -1.19
PUS4P48567 THI6YPL214C 1623 nt7.6□□□□□ -1.19
PUS4P48567 LOT5YKL183W 921 nt7.59□□□□□ -1.19
PUS4P48567 MRS6YOR370C 1812 nt7.59□□□□□ -1.19
PUS4P48567 UFO1YML088W 2007 nt7.59□□□□□ -1.19
PUS4P48567 AGP3YFL055W 1677 nt7.58□□□□□ -1.2
PUS4P48567 UFD1YGR048W 1086 nt7.58□□□□□ -1.2
PUS4P48567 TIM44YIL022W 1296 nt7.58□□□□□ -1.2
PUS4P48567 LSB5YCL034W 1065 nt7.58□□□□□ -1.2
PUS4P48567 DAK2YFL053W 1776 nt7.58□□□□□ -1.2
PUS4P48567 UBP13YBL067C 2244 nt7.57□□□□□ -1.2
PUS4P48567 GCD11YER025W 1584 nt7.56□□□□□ -1.2
PUS4P48567 BNS1YGR230W 414 nt7.56□□□□□ -1.2
PUS4P48567 NUC1YJL208C 990 nt7.56□□□□□ -1.2
PUS4P48567 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.56□□□□□ -1.2
PUS4P48567 YPL277CYPL277C 1464 nt7.55□□□□□ -1.2
PUS4P48567 SNU66YOR308C 1764 nt7.55□□□□□ -1.2
PUS4P48567 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 ACH1YBL015W 1581 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS4P48567 INH1YDL181W 258 nt7.53□□□□□ -1.2
PUS4P48567 FUN14YAL008W 597 nt7.53□□□□□ -1.2
PUS4P48567 PRY1YJL079C 900 nt7.53□□□□□ -1.2
PUS4P48567 SMM1YNR015W 1155 nt7.53□□□□□ -1.2
PUS4P48567 HXT12YIL170W 1374 nt7.53□□□□□ -1.2
PUS4P48567 LPD1YFL018C 1500 nt7.52□□□□□ -1.2
PUS4P48567 GND2YGR256W 1479 nt7.52□□□□□ -1.21
PUS4P48567 CAB5YDR196C 726 nt7.52□□□□□ -1.21
PUS4P48567 YMR103CYMR103C 363 nt7.52□□□□□ -1.21
PUS4P48567 ADE2YOR128C 1716 nt7.52□□□□□ -1.21
PUS4P48567 FIT1YDR534C 1587 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS4P48567 HBS1YKR084C 1836 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS4P48567 MAK32YCR019W 1092 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS4P48567 YLR349WYLR349W 507 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS4P48567 YMR262WYMR262W 942 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS4P48567 STE4YOR212W 1272 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS4P48567 FMS1YMR020W 1527 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS4P48567 RPD3YNL330C 1302 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS4P48567 TOM20YGR082W 552 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS4P48567 RIB7YBR153W 735 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS4P48567 MSC1YML128C 1542 nt7.49□□□□□ -1.21
PUS4P48567 YER188WYER188W 720 nt7.49□□□□□ -1.21
PUS4P48567 RAD51YER095W 1203 nt7.48□□□□□ -1.21
PUS4P48567 ATG17YLR423C 1254 nt7.48□□□□□ -1.21
PUS4P48567 YJL195CYJL195C 702 nt7.47□□□□□ -1.21
PUS4P48567 YHR219WYHR219W 1875 nt7.47□□□□□ -1.21
PUS4P48567 ADH1YOL086C 1047 nt7.46□□□□□ -1.22
PUS4P48567 MAM3YOL060C 2121 nt7.46□□□□□ -1.22
PUS4P48567 YPS3YLR121C 1527 nt7.46□□□□□ -1.22
PUS4P48567 RPT5YOR117W 1305 nt7.46□□□□□ -1.22
PUS4P48567 VRG4YGL225W 1014 nt7.45□□□□□ -1.22
PUS4P48567 KRR1YCL059C 951 nt7.44□□□□□ -1.22
PUS4P48567 CSM1YCR086W 573 nt7.44□□□□□ -1.22
PUS4P48567 YLR122CYLR122C 378 nt7.43□□□□□ -1.22
PUS4P48567 YNR029CYNR029C 1290 nt7.43□□□□□ -1.22
PUS4P48567 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.43□□□□□ -1.22
PUS4P48567 BNI5YNL166C 1347 nt7.43□□□□□ -1.22
PUS4P48567 ECM10YEL030W 1935 nt7.42□□□□□ -1.22
PUS4P48567 LSM5YER146W 282 nt7.42□□□□□ -1.22
PUS4P48567 YEL008WYEL008W 381 nt7.41□□□□□ -1.22
PUS4P48567 ORT1YOR130C 879 nt7.41□□□□□ -1.22
PUS4P48567 OSH7YHR001W 1314 nt7.41□□□□□ -1.22
PUS4P48567 YLR046CYLR046C 813 nt7.4□□□□□ -1.22
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