Protein–RNA interactions for Protein: P29056

BRF1, Transcription factor IIIB 70 kDa subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRF1P29056 MEX67YPL169C 1800 nt8.98□□□□□ -0.97
BRF1P29056 STP3YLR375W 1032 nt8.98□□□□□ -0.97
BRF1P29056 KES1YPL145C 1305 nt8.98□□□□□ -0.97
BRF1P29056 TPS1YBR126C 1488 nt8.97□□□□□ -0.97
BRF1P29056 YBR232CYBR232C 360 nt8.97□□□□□ -0.97
BRF1P29056 DMA2YNL116W 1569 nt8.97□□□□□ -0.97
BRF1P29056 DLD2YDL178W 1593 nt8.96□□□□□ -0.97
BRF1P29056 FLR1YBR008C 1647 nt8.96□□□□□ -0.98
BRF1P29056 OYE2YHR179W 1203 nt8.96□□□□□ -0.98
BRF1P29056 SGA1YIL099W 1650 nt8.96□□□□□ -0.98
BRF1P29056 LPD1YFL018C 1500 nt8.95□□□□□ -0.98
BRF1P29056 PAU5YFL020C 369 nt8.95□□□□□ -0.98
BRF1P29056 SNZ1YMR096W 894 nt8.95□□□□□ -0.98
BRF1P29056 PGC1YPL206C 966 nt8.95□□□□□ -0.98
BRF1P29056 BET2YPR176C 978 nt8.95□□□□□ -0.98
BRF1P29056 TAF13YML098W 504 nt8.94□□□□□ -0.98
BRF1P29056 SNU66YOR308C 1764 nt8.94□□□□□ -0.98
BRF1P29056 RSC8YFR037C 1674 nt8.92□□□□□ -0.98
BRF1P29056 TIM44YIL022W 1296 nt8.92□□□□□ -0.98
BRF1P29056 EAF3YPR023C 1206 nt8.92□□□□□ -0.98
BRF1P29056 YRF1-2YER190W 5046 nt8.92□□□□□ -0.98
BRF1P29056 YPS3YLR121C 1527 nt8.91□□□□□ -0.98
BRF1P29056 FMS1YMR020W 1527 nt8.91□□□□□ -0.98
BRF1P29056 LSB6YJL100W 1824 nt8.91□□□□□ -0.98
BRF1P29056 VPS62YGR141W 1404 nt8.9□□□□□ -0.98
BRF1P29056 YJL064WYJL064W 396 nt8.9□□□□□ -0.98
BRF1P29056 SPP2YOR148C 558 nt8.9□□□□□ -0.98
BRF1P29056 OSH7YHR001W 1314 nt8.89□□□□□ -0.99
BRF1P29056 YPR126CYPR126C 309 nt8.89□□□□□ -0.99
BRF1P29056 YHR218WYHR218W 1812 nt8.89□□□□□ -0.99
BRF1P29056 YDL086WYDL086W 822 nt8.88□□□□□ -0.99
BRF1P29056 UFD1YGR048W 1086 nt8.88□□□□□ -0.99
BRF1P29056 THI6YPL214C 1623 nt8.87□□□□□ -0.99
BRF1P29056 ACH1YBL015W 1581 nt8.87□□□□□ -0.99
BRF1P29056 DAK2YFL053W 1776 nt8.87□□□□□ -0.99
BRF1P29056 RTG2YGL252C 1767 nt8.87□□□□□ -0.99
BRF1P29056 ADE2YOR128C 1716 nt8.86□□□□□ -0.99
BRF1P29056 YMR262WYMR262W 942 nt8.86□□□□□ -0.99
BRF1P29056 PAU19YMR325W 375 nt8.86□□□□□ -0.99
BRF1P29056 MHF1YOL086W-A 273 nt8.86□□□□□ -0.99
BRF1P29056 QDR2YIL121W 1629 nt8.85□□□□□ -0.99
BRF1P29056 HEM13YDR044W 987 nt8.85□□□□□ -0.99
BRF1P29056 TMA23YMR269W 636 nt8.85□□□□□ -0.99
BRF1P29056 CTI6YPL181W 1521 nt8.85□□□□□ -0.99
BRF1P29056 SOL2YCR073W-A 948 nt8.84□□□□□ -0.99
BRF1P29056 DIG1YPL049C 1359 nt8.84□□□□□ -0.99
BRF1P29056 ZAP1YJL056C 2643 nt8.84□□□□□ -1
BRF1P29056 DDI1YER143W 1287 nt8.83□□□□□ -1
BRF1P29056 POT1YIL160C 1254 nt8.83□□□□□ -1
BRF1P29056 IML3YBR107C 738 nt8.83□□□□□ -1
BRF1P29056 DUR3YHL016C 2208 nt8.82□□□□□ -1
BRF1P29056 LSM5YER146W 282 nt8.82□□□□□ -1
BRF1P29056 YJR114WYJR114W 393 nt8.81□□□□□ -1
BRF1P29056 Q0010Q0010 387 nt8.8□□□□□ -1
BRF1P29056 IMO32YGR031W 1029 nt8.79□□□□□ -1
BRF1P29056 GSF2YML048W 1212 nt8.79□□□□□ -1
BRF1P29056 RIB1YBL033C 1038 nt8.79□□□□□ -1
BRF1P29056 TAT2YOL020W 1779 nt8.78□□□□□ -1
BRF1P29056 HXT10YFL011W 1641 nt8.77□□□□□ -1.01
BRF1P29056 SLG1YOR008C 1137 nt8.77□□□□□ -1.01
BRF1P29056 TUB4YLR212C 1422 nt8.77□□□□□ -1.01
BRF1P29056 FIT1YDR534C 1587 nt8.77□□□□□ -1.01
BRF1P29056 GCD11YER025W 1584 nt8.77□□□□□ -1.01
BRF1P29056 PAR32YDL173W 888 nt8.76□□□□□ -1.01
BRF1P29056 YDR455CYDR455C 309 nt8.76□□□□□ -1.01
BRF1P29056 GID8YMR135C 1368 nt8.75□□□□□ -1.01
BRF1P29056 APS2YJR058C 444 nt8.75□□□□□ -1.01
BRF1P29056 ODC1YPL134C 933 nt8.75□□□□□ -1.01
BRF1P29056 NIF3YGL221C 867 nt8.73□□□□□ -1.01
BRF1P29056 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.73□□□□□ -1.01
BRF1P29056 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.73□□□□□ -1.01
BRF1P29056 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.73□□□□□ -1.01
BRF1P29056 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.73□□□□□ -1.01
BRF1P29056 SPS100YHR139C 981 nt8.72□□□□□ -1.01
BRF1P29056 YIA6YIL006W 1122 nt8.72□□□□□ -1.01
BRF1P29056 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.71□□□□□ -1.02
BRF1P29056 RRT8YOL048C 1029 nt8.71□□□□□ -1.02
BRF1P29056 SSL2YIL143C 2532 nt8.71□□□□□ -1.02
BRF1P29056 YKL133CYKL133C 1392 nt8.7□□□□□ -1.02
BRF1P29056 MET30YIL046W 1923 nt8.7□□□□□ -1.02
BRF1P29056 ERG13YML126C 1476 nt8.7□□□□□ -1.02
BRF1P29056 TIP1YBR067C 633 nt8.69□□□□□ -1.02
BRF1P29056 ECM10YEL030W 1935 nt8.69□□□□□ -1.02
BRF1P29056 MAM3YOL060C 2121 nt8.69□□□□□ -1.02
BRF1P29056 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.69□□□□□ -1.02
BRF1P29056 MRS6YOR370C 1812 nt8.68□□□□□ -1.02
BRF1P29056 ADE8YDR408C 645 nt8.68□□□□□ -1.02
BRF1P29056 YEL023CYEL023C 2049 nt8.68□□□□□ -1.02
BRF1P29056 SOD2YHR008C 702 nt8.67□□□□□ -1.02
BRF1P29056 MDM35YKL053C-A 261 nt8.67□□□□□ -1.02
BRF1P29056 ERG6YML008C 1152 nt8.67□□□□□ -1.02
BRF1P29056 CWP2YKL096W-A 279 nt8.66□□□□□ -1.02
BRF1P29056 YJL045WYJL045W 1905 nt8.65□□□□□ -1.02
BRF1P29056 YNL190WYNL190W 615 nt8.65□□□□□ -1.02
BRF1P29056 AIM1YAL046C 357 nt8.64□□□□□ -1.03
BRF1P29056 TVP23YDR084C 600 nt8.63□□□□□ -1.03
BRF1P29056 ABZ2YMR289W 1125 nt8.63□□□□□ -1.03
BRF1P29056 YHR219WYHR219W 1875 nt8.63□□□□□ -1.03
BRF1P29056 NBA1YOL070C 1506 nt8.63□□□□□ -1.03
BRF1P29056 IGD1YFR017C 588 nt8.62□□□□□ -1.03
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