Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRYBB3P26998 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRYBB3P26998 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRYBB3P26998 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms