Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAX3P23760 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAX3P23760 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAX3P23760 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PAX3P23760 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAX3P23760 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAX3P23760 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAX3P23760 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAX3P23760 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAX3P23760 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PAX3P23760 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAX3P23760 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAX3P23760 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAX3P23760 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAX3P23760 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAX3P23760 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAX3P23760 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAX3P23760 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAX3P23760 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAX3P23760 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAX3P23760 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAX3P23760 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAX3P23760 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAX3P23760 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAX3P23760 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAX3P23760 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAX3P23760 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAX3P23760 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAX3P23760 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAX3P23760 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAX3P23760 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAX3P23760 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAX3P23760 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAX3P23760 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PAX3P23760 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAX3P23760 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAX3P23760 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAX3P23760 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAX3P23760 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAX3P23760 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAX3P23760 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PAX3P23760 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAX3P23760 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAX3P23760 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PAX3P23760 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAX3P23760 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAX3P23760 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAX3P23760 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAX3P23760 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAX3P23760 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAX3P23760 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAX3P23760 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAX3P23760 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAX3P23760 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAX3P23760 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAX3P23760 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAX3P23760 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAX3P23760 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAX3P23760 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAX3P23760 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAX3P23760 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAX3P23760 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAX3P23760 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAX3P23760 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PAX3P23760 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAX3P23760 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PAX3P23760 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PAX3P23760 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PAX3P23760 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAX3P23760 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAX3P23760 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAX3P23760 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAX3P23760 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAX3P23760 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAX3P23760 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAX3P23760 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAX3P23760 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAX3P23760 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAX3P23760 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAX3P23760 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PAX3P23760 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAX3P23760 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAX3P23760 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAX3P23760 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAX3P23760 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAX3P23760 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAX3P23760 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAX3P23760 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAX3P23760 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PAX3P23760 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAX3P23760 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PAX3P23760 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAX3P23760 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAX3P23760 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PAX3P23760 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PAX3P23760 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAX3P23760 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAX3P23760 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAX3P23760 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PAX3P23760 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms